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IF-CRIB:一种促进免疫荧光实验的3D打印装置及其在筛选和表征可降解ERK2细胞中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月12日 来源:MethodsX 1.9
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推荐:研究人员针对免疫荧光实验中繁琐洗涤步骤和昂贵设备问题,开发了3D打印洗涤架IF-CRIB及快速IF-Express方案,显著提升多条件实验效率。该技术成功应用于ERK2-dTAG细胞筛选,为ERK信号通路研究和癌症治疗策略开发提供新工具。
在细胞生物学研究中,免疫荧光技术是揭示蛋白质表达和定位的黄金标准,但传统方法存在两大痛点:耗时的手工洗涤步骤和依赖昂贵设备。尤其当涉及高通量筛选时,研究人员常陷入"盖玻片灾难"——顺序错乱、样本丢失、重复性差等问题频发。与此同时,ERK信号通路作为调控细胞增殖和分化的核心通路,其异常激活与50%以上人类癌症密切相关。尽管靶向ERK激酶抑制剂已用于临床,但肿瘤耐药性问题日益突出。近年研究发现,ERK蛋白水平(而非仅激酶活性)同样影响信号输出强度,这为克服耐药性提供了新思路。
法国蔚蓝海岸大学(Université C?te d’Azur)联合法国国家科学研究中心(CNRS)的研究团队在《MethodsX》发表创新成果。他们开发了革命性的3D打印设备IF-CRIB,配合优化的IF-Express方案,不仅解决了免疫荧光实验的技术瓶颈,更成功构建了首个可精准调控ERK2蛋白水平的细胞模型。这项研究为探索"ERK蛋白量-信号强度-药物敏感性"关系奠定了方法学基础。
关键技术包括:1)设计可容纳15片盖玻片的3D打印洗涤架IF-CRIB,支持12-20mm直径样本;2)建立20分钟快速免疫荧光方案IF-Express;3)采用CRISPR-Cas9介导的同源重组技术,将FKPB12F36V-2HA标签插入小鼠ERK2基因第8外显子;4)利用PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体)系统实现ERK2-dTAG的诱导降解;5)通过核转位实验验证工程化ERK2的功能完整性。
【IF-CRIB系统设计】
研究团队从婴儿摇篮获得灵感,设计出由方形支架和带凹槽圆柱组成的模块化设备。3D打印版本支持多种颜色区分实验条件,在75mL洗涤液中可同步处理15个样本。测试表明,该装置使洗涤效率提升3倍,同时将样本错配率降至零。
【ERK2-dTAG细胞模型构建】
通过精妙的基因编辑策略,研究人员在NIH3T3细胞中实现内源性ERK2的C端融合改造。筛选的90个克隆中,30个显示强HA信号,Western blot证实这些克隆表达的ERK2-dTAG分子量增至55kDa(野生型42kDa+标签13kDa)。
【降解动力学验证】
使用PROTAC分子dTAG-13处理时,100nM浓度30分钟即可降解90%ERK2-dTAG。免疫荧光与Western blot结果高度一致,证实IF-CRIB方案的定量可靠性。
【功能表征】
血清饥饿条件下,工程化ERK2主要定位于胞质;经过氧化钒(pervanadate)刺激后发生典型核转位,证明其磷酸化激活功能完好。这为后续研究ERK量效关系提供了理想模型。
这项研究实现了方法学与应用研究的双重突破:在技术上,IF-CRIB的开放式设计使实验室可低成本自制实验设备,配套的IF-Express方案将传统2天流程压缩至2小时;在生物学意义上,构建的ERK2-dTAG细胞填补了ERK蛋白量调控研究的工具空白。特别值得注意的是,该模型仅保留ERK2单等位基因表达(敲除内源性ERK1),这种设计将有助于揭示ERK1/2功能冗余性的分子机制。
研究人员在讨论中展望,未来通过将该系统与ERK抑制剂联用,有望破解"为何降低ERK蛋白量能增强抑制剂效果"的科学谜题。正如团队强调,IF-CRIB的设计文件已公开共享,这种开源精神将加速全球细胞生物学研究的标准化进程。这项成果不仅为MAPK信号通路研究提供新工具,更展现了3D打印技术推动生命科学研究的巨大潜力。
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