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疫苗佐剂数据库ADB的构建及其在免疫治疗毒性预测与功效评估中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月12日 来源:Cell Chemical Biology 7.2
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本研究针对疫苗佐剂系统评价缺乏标准化平台的瓶颈问题,开发了包含25种核心佐剂的转录组数据库ADB。通过整合Open TG-GATEs毒理基因组数据,研究人员建立了机器学习模型,成功预测了秋水仙碱(COL)的佐剂活性和FK565的肝毒性,揭示了转录组特征在佐剂筛选和安全性评估中的重要作用,为疫苗和免疫治疗开发提供了新范式。
在疫苗研发领域,佐剂作为增强免疫应答的关键成分,其安全性和有效性评价长期面临标准化平台缺失的挑战。传统方法受限于生物变异性和实验条件不一致等问题,难以实现高通量筛选。随着mRNA疫苗在新冠疫情防控中展现惊人效果,对佐剂作用机制和毒性预测的系统研究需求愈发迫切。
日本国立保健医疗科学院(National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition)的研究团队在《Cell Chemical Biology》发表重要成果。研究人员构建了首个佐剂专用转录组数据库ADB,涵盖25种临床相关佐剂在小鼠和大鼠多个器官、时间点和剂量下的基因表达谱。通过整合毒理基因组数据库Open TG-GATEs,开发了可同时预测佐剂活性(adjuvanticity)和肝毒性的机器学习模型。
关键技术包括:1)标准化动物实验方案,采集6/24小时多器官转录组数据;2)Affymetrix基因芯片分析;3)支持向量机(SVM)建模;4)跨物种验证实验。研究队列涉及C57BL/6J小鼠和Sprague-Dawley大鼠。
ADB数据库构建与特征分析
通过比较25种佐剂在淋巴结(LN)、脾脏(SP)和肝脏(LV)的差异表达基因(DEGs),发现核酸类佐剂在三种器官中呈现独特聚类模式。主成分分析显示PC1和PC2可解释60%以上变异,其中代谢相关基因在肝脏、免疫相关基因在脾脏特异性富集。
佐剂特异性模式识别
研究发现FK565等佐剂可引发淋巴细胞减少症(lymphopenia),并与560个肝脏基因表达变化显著相关(|r|>0.9)。通过比较TLR9配体(CpG-D35/CpG-K3/K3-SPG)和STING配体(cdiGMP/cGAMP/DMXAA)的转录特征,证实数据库可区分同受体不同佐剂的免疫应答差异。
毒性预测模型验证
基于SVM构建的肝坏死预测模型(AUC=0.794)成功识别NOD1配体FK565的肝毒性。血清ALT检测和组织病理学证实FK565可剂量依赖性升高ALT水平(p<0.05),并下调脂肪酸合酶(Fasn)表达,这与miR-122-5p上调呈现负相关。
佐剂活性新发现
数据驱动的筛选发现抗痛风药物秋水仙碱(colchicine)具有显著佐剂活性。动物实验证实其可诱导ovalbumin特异性IgG抗体(效价提高8倍)和Th1/Th2混合反应(IFN-γ和IL-5分泌增加)。
这项研究建立了首个整合毒理学和免疫学的佐剂评价平台,其创新性体现在:1)揭示转录组特征可作为佐剂"分子指纹";2)开发双功能预测模型;3)发现秋水仙碱的免疫调节新功能。ADB数据库与OTG的整合为理性佐剂设计提供了系统生物学框架,不仅加速了疫苗开发进程,也为肿瘤免疫治疗和感染性疾病防治提供了新思路。特别值得注意的是,该研究通过完全数据驱动的方法发现了传统药物的新适应症,展现了组学技术在药物重定位中的巨大潜力。
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