孟加拉斑节对虾源多重耐药锰氧化普罗威登斯菌(Providencia manganoxydans)基因组草图解析及其水产应用潜力

来自孟加拉的研究人员针对水产养殖中锰污染治理难题，完成了两株斑节对虾源锰氧化普罗威登斯菌(Providencia manganoxydans)BD001/BD002的全基因组测序。研究揭示其4.7Mbp基因组携带6个抗生素抗性基因(ARGs)和移动遗传元件(MGEs)，虽具潜在致病性(评分0.518)，但对四环素类等5种药物完全敏感，为开发环境友好型锰污染生物修复剂提供了重要分子基础。

　　

在蓬勃发展的对虾养殖业中，锰氧化普罗威登斯菌(Providencia manganoxydans)这个革兰氏阴性菌正引发科研人员的浓厚兴趣。这种神奇的微生物能将可溶性Mn²⁺转化为不溶性Mn⁴⁺，就像天然的"锰净化器"，有望解决高密度养殖中常见的重金属污染难题。

研究人员从孟加拉库尔纳地区的斑节对虾(Penaeus monodon)肠道中分离出两株菌株BD001和BD002。通过脑心浸液(BHI)培养基富集和硫代硫酸盐-柠檬酸盐-胆盐-蔗糖(TCBS)平板筛选，结合VITEK-2微生物鉴定系统，确认了这两株"锰转化专家"的身份。

基因组测序大戏在Illumina MiSeq平台上精彩上演：BD001产生376.3百万碱基的测序数据(80×覆盖度)，BD002更是达到613.4百万碱基(130×覆盖度)。SPAdes组装和QUAST评估显示，两个基因组都约4.7Mbp大小，GC含量分别为40.7%和40.0%。有趣的是，它们都携带6个抗生素抗性基因(ARGs)和多个移动遗传元件(MGEs)，但幸运的是没有检测到毒力因子(VFGs)。

这两株菌就像"矛盾综合体"：虽然PathogenFinder预测它们有0.518的致病概率，但对四环素类(如oxytetracycline)、左氧氟沙星(levofloxacin)等药物却出奇地敏感。更引人注目的是，RAST分析发现它们拥有25个代谢子系统，还携带3个完整的前噬菌体和2个细菌素基因簇，简直就是"微生物界的瑞士军刀"。

这项研究为理解锰氧化菌在水产养殖中的双重角色打开了新窗口——既是潜在的生物修复剂，又是需要警惕的多重耐药菌株。特别是发现它们对四环素类药物的敏感性，为开发针对性防控策略提供了关键线索。