康普茶源库德里阿兹威氏毕赤酵母(Pichia kudriavzevii)NCYC 4488菌株基因组草图解析

来自英国的研究团队针对具有重要工业价值与临床意义的发酵酵母——库德里阿兹威氏毕赤酵母(Pichia kudriavzevii)，采用Illumina短读长与Nanopore长读长测序技术相结合的策略，成功组装获得康普茶分离株NCYC 4488的高质量基因组草图。该研究不仅揭示了4条染色体级contig的端粒重复序列特征，更通过BUSCO评估证实96.2%的基因组完整性，为深入探究该酵母在食品发酵、生物技术及病原机制等多领域的应用奠定分子基础。

　　

在微生物研究的璀璨星河中，库德里阿兹威氏毕赤酵母(Pichia kudriavzevii，又名Candida krusei)堪称多面手——既是传统发酵饮料的得力干将，又是新兴生物技术的潜力股，同时还戴着机会性病原体的"危险面具"。科研人员从英国有机康普茶中分离获得NCYC 4488菌株，通过脑心浸液琼脂(BHI)培养和D1/D2区测序鉴定后，展开了一场基因组解谜之旅。

研究团队玩转"长短枪"组合：Illumina NextSeq 500产出799万条150bp双端读长(111×覆盖度)，牛津纳米孔技术(ONT)MinION平台则贡献平均长度4,687bp的77万条读长(337×覆盖度)。经过Flye软件组装和三轮Pilon抛光，最终获得包含4条染色体级contig的10.88Mb基因组草图，GC含量38.40%，N₅₀达2.75Mb。这些contig末端暗藏玄机——要么是28bp端粒重复序列(TTACAATATGAACTAGGAGCGAGGTGTG)_n，要么是核糖体DNA阵列。

更令人振奋的是，通过BUSCO评估显示96.2%的基因组完整性，预测出5,063个蛋白质编码基因和175个tRNA基因。这些数据为理解该酵母在发酵过程中的代谢网络、益生特性形成机制，以及临床耐药性进化提供了宝贵的分子蓝图。研究获得英国生物技术与生物科学研究理事会(BBSRC)资助，相关序列已存入GenBank(PV526257.1)。