盐生植物内生菌Bacillus halotolerans Can19L基因组测序及其生物合成潜力解析

来自俄罗斯的研究团队对耐盐杂草Chenopodium album L.叶片中分离的内生菌Bacillus halotolerans Can19L进行全基因组测序。该研究采用Illumina NextSeq 1000平台获得1,176,787条150 bp双端 reads，经SPAdes v3.14.1组装得到6个contigs（4,113,353 bp，GC含量43.7%）。通过antiSMASH v7.1.0分析发现其含有fengycin、bacillaene等8种次级代谢产物合成基因簇，为植物抗逆促生机制研究提供重要资源。

　　

在俄罗斯斯塔夫罗波尔地区(44°50'28.0"N 44°30'22.0"E)采集的藜科耐盐植物Chenopodium album L.叶片中，科研人员分离获得一株具有研究价值的内生菌Can19L。通过表面消毒、组织匀浆及稀释涂布法，该菌株在1/20浓度胰蛋白胨大豆琼脂(TSA)平板上成功分离。

基因组测序采用Illumina NextSeq 1000平台配合300循环P1试剂盒，产生1,176,787对150 bp双端reads。经SPAdes软件"careful"模式组装和RagTag基因组支架构建，最终获得6条contigs，总长4.11 Mb，N50达4.1 Mb。FastANI分析显示该菌株与Bacillus halotolerans参考基因组(GCF_004006435.1)平均核苷酸相似性达99.3%。

质量评估显示基因组覆盖深度85.7×，完整度99.8%，污染率仅0.59%。NCBIPGAP注释发现4,261个基因，antiSMASH分析揭示其含有8类生物活性物质合成基因簇，包括抗菌肽fengycin、表面活性素surfactin、铁载体bacillibactin等。特别值得注意的是，该菌株与已报道的促生菌KKD1类似，可能通过调控植物激素合成和渗透平衡来增强作物耐盐性。

研究获得俄罗斯科学基金(23-66-10013)支持，测序工作在ARRIAM基因组技术中心和Lopukhin FRCC PCM核心设施完成。该基因组数据为开发新型植物促生菌剂提供了重要分子基础。