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韩国活禽市场首次分离禽副黏病毒14型全基因组测序及分子特征分析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月12日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6
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来自韩国的研究人员针对禽副黏病毒(APMV)血清型多样性问题,对活禽市场健康鸡只分离的APMV-14毒株(命名为Ck/Korea)进行全基因组测序。研究发现该毒株基因组全长15,444nt,与日本(Dk/Japan)和中国(Ck/China)毒株同源性分别为91.1%和88.4%,其血凝素-神经氨酸酶(HN)蛋白长度因终止密码子位置差异呈现587/580/607个氨基酸变异,F蛋白弗林蛋白酶切割位点(TREGR↓L)特征为评估潜在致病性提供重要线索。
禽副黏病毒(APMV)家族再添新成员!科研人员在韩国清州市活禽市场的一次常规监测中,从外表健康的肉鸡体内捕获一株神秘的APMV-14型病毒。通过鸡胚接种和Illumina测序平台的精密操作,研究人员像拼图大师般将181,949条测序reads拼接成完整的15,444个核苷酸基因组——这个严格遵守"六的法则"的RNA分子,藏着六个关键蛋白的遗传密码。
比较基因组学揭示有趣现象:韩国分离株(Ck/Korea)与日本水禽株(Dk/Japan)和中国鸡源株(Ck/China)玩起了"大家来找茬"游戏,基因组相似度分别为91.1%和88.4%。最精彩的发现当属血凝素-神经氨酸酶(HN)蛋白的"伸缩魔术":由于终止密码子的位置变化,这三个毒株的HN蛋白长度分别为587、580和607个氨基酸。而关乎病毒致病力的F蛋白切割位点(TREGR↓L)则显示出韩国株与中国株的"默契配合",与日本株的TREGK↓L形成鲜明对比。
这项发表在未知期刊的研究,不仅为APMV-14的分子流行病学拼图补上关键韩国板块,更通过1,203×的超高测序深度和95.7%的Q30优质数据,为后续监测这种可能威胁家禽健康的病毒奠定坚实基础。国家研究基金会(NRF)资助的这项工程,犹如在病毒猎场布下天罗地网,静候下一个可能出现的变异毒株。
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