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原发性低级别胶质瘤免疫相关基因特征的预后预测及免疫微环境解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月13日 来源:BioMed Research International 2.3
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(编辑推荐)本研究通过系统生物信息学分析构建了包含CXCL10、ICAM1、IL18、ITGAL、SOCS3和TLR3的六基因免疫相关特征(IRGs),能有效预测低级别胶质瘤(LGG)患者预后。采用ssGSEA和CIBERSORT算法揭示高风险组具有更强的免疫浸润特征,且风险评分与TIM3等免疫检查点显著正相关。该模型为LGG的分子诊断和个体化免疫治疗提供了新依据。
胶质瘤作为中枢神经系统最常见的原发性恶性肿瘤,其侵袭性和异质性导致临床治疗困难。低级别胶质瘤(LGG)包含WHO II-III级肿瘤,易进展为胶质母细胞瘤(GBM)。研究团队基于肿瘤微环境(TME)中免疫相关基因(IRGs)的动态调控,提出通过生物信息学方法构建预后模型,为精准治疗提供新策略。
数据采集:整合TCGA(511例LGG)和CGGA(592例)数据库,结合GTEx正常脑组织数据。从ImmPort数据库筛选1793个IRGs。
免疫景观解析:采用单样本基因集富集分析(ssGSEA)评估29种免疫特征,通过CIBERSORT量化22种免疫细胞浸润。
模型构建:通过LASSO回归和Cox分析筛选出6个核心基因(CXCL10、ICAM1、IL18、ITGAL、SOCS3、TLR3),建立风险评分公式:风险评分=∑(基因表达×回归系数)。
免疫分型:ssGSEA将患者分为免疫高/低组(immunity_H/L),immunity_H组显示更高的基质评分、免疫评分和ESTIMATE评分(p<0.001),且CD8+ T细胞、M1巨噬细胞等效应免疫细胞显著富集。
预后模型:高风险组总生存期(OS)显著缩短(TCGA队列5年AUC=0.662)。风险评分是独立预后因素(HR=1.361,95%CI=1.274–1.453)。
免疫检查点关联:风险评分与TIM3(HAVCR2)表达强正相关(TCGA中Cor=0.522,CGGA中Cor=0.571)。
实验验证:qPCR和Western blot证实6个基因在LGG组织中表达显著高于癌旁组织(p<0.05)。
基因功能:
CXCL10:通过招募CD8+ T细胞和NK细胞增强抗肿瘤免疫。
ICAM1:促进巨噬细胞浸润,与IDH突变负相关。
SOCS3:缺失可增加M1型巨噬细胞极化,减少Tregs浸润。
临床意义:模型揭示了LGG免疫抑制微环境的异质性,高风险组可能对TIM3抑制剂更敏感。
该六基因特征可精准预测LGG预后,其与免疫检查点的关联为联合免疫治疗提供理论依据。未来需扩大临床样本验证模型的普适性。
(注:全文数据均来自TCGA/CGGA数据库及16例临床样本的湿实验验证,符合伦理审批号H2023206913。)
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