从寄生毛蕨根际土壤中发现放线菌新种——链霉菌属新成员"环孢链霉菌(Streptomyces cyclosori sp. nov.)"的分类学研究

研究人员从寄生毛蕨(Cyclosorus parasiticus)根际土壤中分离得到一株放线菌新菌株cg36T，通过多相分类学研究证实其为一新种。该研究采用16S rRNA基因序列分析、全基因组测序(9,022,416 bp)、整体基因组相关性指数(OGRI)和多基因座序列分析(MLSA)等技术手段，确定该菌株与相近种Streptomyces crystallinus和S. noboritoensis存在显著差异。菌株特征分析显示其含有LL-二氨基庚二酸、葡萄糖等特征组分，主要脂肪酸为anteiso-C15:0、iso-C15:0和C16:0，基因组GC含量达72.5%。该发现为微生物资源库增添了新成员，菌株保藏编号为MCCC 1K09286T=JCM 37520T。

　　

科研团队在寄生毛蕨(Cyclosorus parasiticus)的根际土壤中发现了一株编号为cg36^T的放线菌新菌株。通过多相分类学(polyphasic taxonomy)研究揭示，该菌株的16S rRNA基因序列与薰衣草链霉菌(Streptomyces lavendofoliae)NBRC 12882^T相似度最高。有趣的是，系统发育分析显示cg36^T在链霉菌属中自成一支。

更深入的研究采用五个看家基因(housekeeping genes)和全基因组序列分析，发现该菌株与结晶链霉菌(S. crystallinus)JCM 5067^T及登户链霉菌(S. noboritoensis)JCM 4557^T亲缘较近。但整体基因组相关性指数(OGRI)和多基因座序列分析(MLSA)数据证实，cg36^T确实是个与众不同的新物种。

生化特征分析显示，这株"微生物界新秀"的细胞壁含有LL-二氨基庚二酸(LL-DAP)，全细胞糖类含葡萄糖。其脂肪酸组成也颇具特色，主要成分包括anteiso-C_15:0(反异十五烷酸)、iso-C_15:0(异十五烷酸)和C_16:0(棕榈酸)，含量均超过10%。基因组测序显示其DNA长度达9,022,416碱基对，GC含量高达72.5%。

基于这些确凿证据，研究人员正式将这个微生物新贵命名为环孢链霉菌(Streptomyces cyclosori sp. nov.)，模式菌株为cg36^T(=MCCC 1K09286^T=JCM 37520^T)，为链霉菌家族再添新成员。