哈萨克斯坦犬源SARS-CoV-2全基因组测序揭示Delta变异株跨种传播特征

来自哈萨克斯坦的研究团队通过监测家养动物中的冠状病毒，成功从阿拉木图犬只直肠拭子中分离出SARS-CoV-2全基因组。该毒株被鉴定为B谱系早期分支（与Delta变异株B.1.617.2高度相似），携带S:D614G等18个特征性突变，为理解病毒人畜共患病传播机制提供了关键分子证据。

　　

在新冠病毒(SARS-CoV-2)大流行背景下，哈萨克斯坦科学家展开了一项突破性研究——从出现轻微呼吸道症状的宠物犬直肠拭子中捕获到活病毒。通过Ion Torrent高通量测序技术，研究团队成功解析出29,903bp的完整基因组（测序深度达2,530×），GC含量为38.0%。

系统发育树显示，这个被命名为SARS-CoV-2/Canis lupus familiaris/KAZ/CCoV_Almaty_KZ_2022的毒株，与2021-2022年流行的Delta变异株(B.1.617.2)共享99%核苷酸相似度。尤为值得注意的是，其刺突蛋白(S蛋白)存在10个关键突变，包括著名的D614G位点变异，ORF1ab区则检测到K1037T等8个氨基酸替换。

实验采用三级盲传培养法，在非洲绿猴肾细胞(Vero cells, ATCC CRL-1586)中成功扩增病毒。通过靶向ORF1ab和N基因的RT-qPCR检测，结合Tamura-Nei模型构建进化树，揭示该毒株与欧亚人类流行株的密切关联。这些发现为冠状病毒跨物种传播的分子机制提供了重要线索，尤其凸显伴侣动物在病毒生态循环中的潜在作用。

研究获得哈萨克斯坦科教部资助（项目号AR13067641），所有实验均通过生物安全研究所伦理审查（2021年11月29日第5号协议）。数据已提交GenBank，完整基因组可参考登录号MN908947.3进行比对分析。