美国新泽西州野生东部箱龟中蛙病毒3型全基因组测序及进化分析

来自美国的研究团队针对蛙病毒3型(FV3)在爬行动物中的跨物种传播问题，完成了首例野生东部箱龟(Terrapene carolina carolina)源FV3毒株的全基因组测序。通过比较基因组学和系统发育分析，证实该毒株与爬行动物源FV3具有高度同源性，为北美箱龟病毒性疾病的防控提供了重要分子依据。

　　

科研人员从美国新泽西州格洛斯特县一只新鲜死亡的野生东部箱龟中分离出蛙病毒3型(Frog virus 3, FV3)毒株。该龟体表呈现典型的口舌炎病变，研究人员随即采集其肺、肝、肾和脾脏组织进行混合处理。通过15°C条件下接种鲤上皮瘤细胞(EPC)，观察到明显细胞病变效应(CPE)后，采用QIAamp DNA Micro试剂盒提取病毒DNA。

Illumina NextSeq2000测序平台产生10,143,222条双端读长，经CLC Genomics Workbench分析获得105,011 bp的完整基因组(GC含量55%)。BLASTN比对显示该毒株(命名为TCCRV-NJ)与爬行动物源FV3毒株相似度>99%。基因组注释预测95个开放阅读框，系统发育分析将其归类于FV3进化支，与棘鱼病毒(SBV)和红腿蛙病毒(TV2)构成姐妹群。

值得注意的是，该毒株与北美箱龟源毒株聚集成簇，证实FV3可在龟类群体中稳定传播。尽管病毒与龟类死亡的直接因果关系尚未明确，但研究强调需警惕FV3对新泽西野生箱龟种群的潜在威胁。研究采用的高通量测序和比较基因组学方法，为虹彩病毒科(Iridoviridae)成员跨物种传播机制研究提供了新视角。