水貂脾脏感染阿留申病毒(AMDV)的转录组特征解析:免疫应答机制新视角

【字体: 时间:2025年08月13日 来源:Research in Veterinary Science 1.8

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  研究人员针对阿留申病(AD)导致水貂高死亡率及经济性状下降的问题,通过转录组测序技术分析AMDV感染后水貂脾脏的基因表达变化。研究发现168个差异表达基因(DEGs),其中8个免疫相关基因(FGL2、TLR8等)和中性粒细胞脱颗粒通路在早期感染中起关键作用,为水貂抗病育种提供了分子标记和通路依据。

  

阿留申病(AD)是困扰全球水貂养殖业的头号传染病,由阿留申病毒(AMDV)引发,不仅造成高达30%的死亡率,还会导致毛皮质量下降、繁殖性能降低等经济损失。更棘手的是,传统疫苗和药物治疗收效甚微,养殖户只能通过选育抗病水貂来控制疫情。但抗病育种面临巨大挑战——科学家对水貂抵抗AMDV的分子机制知之甚少。

加拿大达尔豪斯大学(Dalhousie University)的研究团队将目光聚焦在脾脏这个"免疫战场"。脾脏不仅是AMDV的主要靶器官,更是机体对抗血液病原体的第一道防线。研究人员设计了一项精细的时序实验:选取12只AMDV阴性水貂,通过鼻腔接种病毒后,分别在感染后1天(Day1)、2天(Day2)和7天(Day7)采集脾脏样本,与未感染组(Day0)对比。利用Illumina HiScanSQ平台进行101bp双端测序,获得9.42亿条高质量 reads,通过Tophat2比对和Cuffdiff分析发现:

3.1 差异基因表达

感染后1天即出现168个显著差异基因(DEGs),76%基因上调,包括补体成分C3和自噬相关基因IRGM1。随时间推移,DEGs数量减少至23个( Day7),但8个免疫相关基因(FGL2、TLR8、LRP1、SERPINB9、MSR1、C3、PLA2R1和XCR1)持续表达。特别值得注意的是,非编码RNA LOC122895916在Day1上调8.4倍,可能是AMDV感染的新调控因子。

3.2 富集分析

Day1的DEGs显著富集于中性粒细胞脱颗粒(Neutrophil degranulation)和PPAR信号通路,提示先天免疫和脂代谢的早期激活。Day7则转向适应性免疫相关通路,如细胞因子-受体相互作用(chemokine signaling pathway)。蛋白互作网络显示,补体C3和趋化因子CCL5是Day7的核心枢纽基因。

这项研究首次绘制了AMDV感染后水貂脾脏的动态转录图谱,揭示免疫应答从先天免疫向适应性免疫的转换规律。发现的候选基因不仅为抗病育种提供分子标记,更揭示了AMDV逃避免疫的潜在机制——病毒可能通过调控脂代谢通路干扰宿主防御。研究团队建议未来开展单细胞测序,以解析不同免疫细胞的应答异质性。论文发表于《Research in Veterinary Science》,为攻克水貂阿留申病提供了重要理论依据。

(关键技术方法:采用12只AMDV阴性水貂建立感染模型,使用Illumina TruSeq? RNA kit构建文库,HiScanSQ平台进行101bp双端测序。经Cutadapt v1.4.2质控后,用Tophat2比对至水貂参考基因组,Cufflinks进行转录本定量,设定FDR<0.05为差异表达阈值。通过PANTHER和KEGG进行通路富集分析,STRING构建蛋白互作网络。)

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