靶向分离H2依赖性甲基营养型产甲烷菌的鸡尾酒式四阶段策略

【字体: 时间:2025年08月14日 来源:Nature Protocols 16

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  为解决传统方法难以培养H2依赖性甲基营养型产甲烷菌(HMMs)的难题,研究人员开发了一种四阶段选择性分离策略。通过封闭批次培养、连续稀释、抗生素处理和分子监测相结合,首次成功分离出热变形菌门HMM纯培养物Methanosuratincola petrocarbonis LWZ-6,为研究全球碳循环和气候变化提供了关键菌株资源。

  

产甲烷古菌(methanogenic archaea)作为全球碳循环和气候变化的关键参与者,其H2依赖性甲基营养型(H2-dependent methylotrophic methanogens, HMMs)在各类环境中广泛存在却难以培养。这项研究创新性地采用四阶段"鸡尾酒"策略:首先通过>50种条件的封闭批次培养优化目标HMM生长环境;接着利用96孔板连续稀释结合底物限制清除非目标古菌;随后通过抗生素-溶菌酶联用将细菌多样性降至单一菌株;最终通过反复抗生素鸡尾酒处理获得热变形菌门(Thermoproteota)HMM纯培养物Methanosuratincola petrocarbonis LWZ-6。研究同步采用16S rRNA基因扩增子测序、宏基因组测序和qPCR等分子手段,实时监测微生物群落演替并验证目标HMM的生长优势。该方案可根据不同HMM的底物利用特性、生长速率和方法选择灵活调整,为突破难培养微生物分离瓶颈提供了标准化技术路线。

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