燕麦BZR转录因子家族全基因组鉴定及渗透胁迫响应机制研究

【字体: 时间:2025年08月15日 来源:Frontiers in Plant Science 4.8

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  这篇研究通过全基因组分析系统鉴定了燕麦(Avena sativa)中14个Brassinazole-resistant(BZR)基因家族成员,揭示了其染色体分布、系统进化和结构特征。研究发现AsBZR基因启动子富含激素响应(如ABA、MeJA)和胁迫相关顺式元件,并通过片段重复事件进化。qRT-PCR证实AsBZR12在根、茎、叶中显著上调,亚细胞定位显示其定位于细胞核,为解析燕麦渗透胁迫(15% PEG 6000模拟)响应机制提供了关键候选基因。

  

1 引言

油菜素内酯(BRs)作为植物固醇激素,通过BZR/BES1转录因子调控生长发育及逆境响应。燕麦作为耐逆性强的六倍体作物(AACCDD,2n=6x=42),其BZR家族功能尚未明确。研究基于燕麦参考基因组,结合BLASTP和HMM方法鉴定基因家族,并利用PEG 6000模拟干旱胁迫,探究AsBZR在渗透胁迫中的表达模式。

2 材料与方法

2.1 基因鉴定

从GrainGenes数据库获取燕麦基因组数据,以拟南芥(AtBZR)和水稻(OsBZR)序列为查询,通过Pfam、CDD和SMART验证BZR结构域。

2.2 进化与结构分析

使用MEGA 7.0构建邻接法系统进化树,MEME鉴定保守基序,TBtools可视化基因结构。启动子顺式元件通过PlantCARE预测。

2.3 表达分析

以品种"品燕8号"为材料,15% PEG 6000处理不同时间点(6-72 h),qRT-PCR检测根、茎、叶中AsBZR表达,AsActin为内参。

2.4 亚细胞定位

将AsBZR12-GFP融合载体通过农杆菌(GV3101)瞬时转化本氏烟草,共定位核标记NLS-mCherry,激光共聚焦观察。

3 结果

3.1 基因特征

鉴定14个AsBZR基因,编码322-685个氨基酸,等电点5.36-9.45,均含核定位信号。染色体分布显示基因不均匀分布于12条染色体,6号同源群含4个基因。

3.2 进化分组

系统发育分为3组:Group I(8成员)含特有基序2,Group III(4成员)含基序4/6/7。基因结构显示Group I/II含1个内含子,Group III含9-10个外显子。

3.3 顺式元件

启动子含大量激素响应元件(ABRE、MeJA-box)及胁迫相关元件(低温、缺氧响应),暗示其参与多重应激调控。

3.4 扩张机制

共鉴定19个片段重复事件,Ka/Ks值0.00-0.38表明纯化选择驱动进化。与小麦(TaBZR)共线性强于水稻,反映近缘关系。

3.5 表达模式

AsBZR12在根(24 h上调4.5倍)、叶(48 h达峰)和茎中持续高表达。亚细胞定位证实其核定位特性。

4 讨论

燕麦BZR家族扩张与六倍体化事件相关,AsBZR12的跨组织胁迫响应提示其核心调控作用。与小麦TaBZR7同源基因的保守性为分子设计育种提供靶点。未来需通过基因编辑验证AsBZR12功能,解析其下游网络。

5 结论

研究首次揭示燕麦BZR家族的系统特征,明确AsBZR12为渗透胁迫关键应答因子,为燕麦抗逆遗传改良奠定理论基础。

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