伊朗北部波斯葱中韭葱黄条病毒(LYSV)的首次鉴定及其分子特征分析

本研究首次报道了韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus, LYSV)在伊朗北部波斯葱(Allium hirtifolium)中的感染情况。研究人员通过RT-PCR和特异性引物扩增技术，从表现花叶和黄条纹症状的样本中鉴定出LYSV，并对其CI和CP基因进行测序分析，发现与中国分离株具有高度相似性。该发现为伊朗葱属作物病毒病防控提供了重要依据。

　　

在葱属作物种植区，病毒性病害一直是影响产量和品质的重要因素。其中，韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus, LYSV)作为一种危害严重的马铃薯Y病毒科(Potyvirus)成员，已在全球多个地区的葱蒜类作物中被检出。这种病毒通过蚜虫以非持久性方式传播，可导致叶片出现特征性黄条纹和花叶症状，造成显著产量损失。在伊朗，作为重要经济作物的波斯葱(Allium hirtifolium，当地称为Moosir)不仅具有独特的食用价值，还因其药用特性而备受推崇。然而，此前关于LYSV在该作物中的感染情况尚未见报道。

2024年10月，研究人员在伊朗北部马赞达兰省的三块波斯葱种植田中发现部分植株表现出典型的病毒病症状，包括叶片花叶、黄条纹和条斑。为明确病原，研究人员采集了6株表现症状的植株样本，采用SV Total RNA Isolation Kit提取总RNA。通过使用针对马铃薯Y病毒科保守区域的简并引物CI-For/CI-Rev进行反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)，成功从4个样本中扩增出约700 bp的片段，该片段对应于病毒基因组中CI(cylindrical inclusion)蛋白编码区。

测序和BLAST分析显示，其中3个样本与LYSV的相似性≥99%，另一个样本则与洋葱黄矮病毒(onion yellow dwarf virus)匹配。为确证LYSV的存在，研究人员进一步使用特异性引物CPF/R扩增完整的病毒外壳蛋白(CP)基因(~864 bp)，最终在3个样本中确认了LYSV感染。

分子特征分析表明，分离株IR-SQ的CI区域与中国分离株(MN059436-MN059438)具有93.6%的核苷酸和97.4%的氨基酸相似性，与伊朗大蒜分离株IR-AE65(MT232838)的相似性分别为85.7%和97.8%。在CP区域，IR-SQ与中国分离株(MN059437、MN059438和MN059504)的核苷酸相似性达96.1-96.3%，氨基酸相似性为97.6%。这些数据不仅首次证实了LYSV对伊朗波斯葱的感染，也为理解该病毒在伊朗的分子流行病学特征提供了重要线索。

从技术方法来看，该研究主要采用了：1) 从马赞达兰省田间采集表现症状的波斯葱样本；2) 使用RT-PCR技术进行初步筛查；3) 通过特异性引物扩增关键基因区域；4) 克隆测序和生物信息学分析。

研究结果部分显示：

1. 1.

   通过简并引物扩增成功从波斯葱样本中获得预期大小的片段，测序分析确认了LYSV的存在；

2. 2.

   特异性引物扩增进一步验证了LYSV感染，并获得了完整的CP基因序列；

3. 3.

   分子进化分析揭示了伊朗分离株与中国分离株的密切关系，同时显示出与本地大蒜分离株的明显差异。

这项研究的结论具有重要意义：首先，它首次报道了LYSV对伊朗特有作物波斯葱的感染，扩展了该病毒的寄主范围认知；其次，通过分子特征分析为理解LYSV在伊朗的传播和进化提供了基础数据；最后，该发现对制定波斯葱病毒病防控策略具有指导价值。研究人员已将相关序列提交至GenBank(登录号PQ768515和PV226225)，为后续研究提供了重要参考。