双向液-液相分离特征的多组学分析揭示肾细胞癌免疫治疗反应与预后新机制

本研究针对肾透明细胞癌(ccRCC)诊断和治疗瓶颈，通过整合多组学数据与孟德尔随机化(MR)分析，首次构建了双向液-液相分离相关指数(B-LLPSI)。该研究鉴定出GPRIN1、TTK和DTL三个关键相分离调控因子，揭示高B-LLPSI组虽预后较差但免疫治疗响应更佳的双向调控特征，为个体化肿瘤治疗提供了新型分子标志物和潜在靶点。

　　

肾细胞癌作为泌尿系统高发恶性肿瘤，其最普遍的肾透明细胞癌(ccRCC)亚型占病例的75-85%。尽管手术和靶向治疗取得进展，但早期诊断困难、靶向治疗耐药和免疫治疗响应率低仍是临床重大挑战。近年来，液-液相分离(LLPS)作为调控基因表达、DNA修复等关键生物学过程的新机制，在肿瘤发生发展中展现出重要作用，但在ccRCC中的研究仍属空白。中国医科大学附属第一医院的研究团队通过创新性多组学分析，揭示了LLPS调控ccRCC进展的双刃剑特性，相关成果发表于《BMC Cancer》。

研究采用孟德尔随机化筛选ccRCC相关LLPS基因，基于TCGA等公共数据库构建训练集和验证集，通过LASSO回归建立B-LLPSI模型。关键技术包括：1)整合TCGA-KIRC和E-MTAB-1980队列进行生存分析；2)利用CIBERSORT和ESTIMATE算法评估免疫微环境；3)通过GDSC数据库预测药物敏感性；4)采用Schr?dinger软件进行TTK蛋白分子对接；5)体外实验验证基因功能。

研究结果部分：

1. 1.

   ccRCC特征性LLPS基因鉴定：通过SMR分析筛选出19个LLPS相关基因，其中TTK、DTL和GPRIN1经生存分析确认为核心因子。

2. 2.

   B-LLPSI构建与验证：建立公式B-LLPSI=(TTK×0.854)-(DTL×0.451)+(GPRIN1×0.302)，在TCGA和E-MTAB-1980队列中均显示高B-LLPSI组预后更差(AUC 0.647-0.746)。

3. 3.

   免疫微环境与治疗响应：高B-LLPSI组呈现"热肿瘤"特征，CD8⁺T细胞浸润增加，免疫检查点(PD-1/CTLA-4)表达上调，对PD-1抑制剂响应率提高2.3倍。

4. 4.

   突变特征分析：B-LLPSI与肿瘤突变负荷(TMB)正相关(r=0.42)，高B-LLPSI组VHL、PBRM1突变频率显著。

5. 5.

   药物筛选与机制验证：发现Navitoclax等6种潜在靶向药物，体外实验证实敲低TTK/DTL/GPRIN1可抑制癌细胞增殖(EdU阳性率下降58%)和迁移(Transwell细胞数减少72%)。

结论部分指出，B-LLPSI首次揭示了LLPS在ccRCC中的双向调控作用：一方面通过TTK-DTL-GPRIN1轴促进肿瘤进展，另一方面增强免疫原性从而提高免疫治疗响应。该研究不仅为ccRCC预后预测提供了新型工具，更重要的是发现了"预后差但免疫治疗敏感"的特殊亚群，为临床治疗策略制定提供了分子依据。分子对接筛选的小分子化合物为克服当前靶向治疗耐药性开辟了新途径。值得注意的是，B-LLPSI在ACC、LIHC等9种癌症中均显示预后预测价值，暗示LLPS可能是跨癌种的共性调控机制。

讨论部分强调，该研究存在样本来源单一等局限性，但通过多队列验证和实验补充增强了结论可靠性。未来需探究TTK等基因的相分离具体机制，如TTK是否通过形成核内凝聚体调控染色体稳定性。临床转化方面，建议开展前瞻性试验验证B-LLPSI指导下的个体化治疗策略，特别是免疫治疗与靶向药物的序贯应用。