鼻咽微生物群差异模式：肺炎链球菌肺炎、COVID-19与健康成人的比较研究

本研究针对下呼吸道感染（LRIs）的致病机制，通过比较肺炎链球菌肺炎（PPn）、COVID-19肺炎（CPn）与健康成人（HC）的鼻咽微生物群（NM）特征，揭示了不同病原体感染下微生物组成的显著差异。研究采用16S rRNA基因测序和随机森林模型，发现CPn患者以棒状杆菌（Corynebacterium）为主，而PPn患者链球菌（Streptococcus）丰度更高，为理解微生物群在疾病进展中的作用提供了新视角。

　　

下呼吸道感染（LRIs）是全球范围内导致死亡的主要原因之一，其病原体如肺炎链球菌（Streptococcus pneumoniae）和呼吸道病毒的表现复杂多样，可从无症状定植发展为严重侵袭性疾病。尽管已知宿主因素和环境条件影响疾病进程，但鼻咽微生物群（NM）在其中的作用尚未完全阐明。这一领域的空白促使来自Universitat Internacional de Catalunya（国际加泰罗尼亚大学）的研究团队开展了一项前瞻性病例对照研究，旨在揭示不同疾病状态下NM的差异模式，相关成果发表在《Journal of Industrial Information Integration》上。

研究团队采用16S rRNA基因测序技术，分析了129例样本（38例PPn、54例CPn和37例HC）的微生物组成，并通过随机森林模型区分细菌性与病毒性社区获得性肺炎（CAP）。样本采集于2021年2月至2022年9月，严格匹配了年龄和性别等混杂因素。

结果部分显示：

1. 1.

   微生物多样性分析：Alpha多样性（物种丰富度和均匀度）无组间差异，但Beta多样性分析表明CPn患者以棒状杆菌（Corynebacterium）为主导，而PPn患者链球菌（Streptococcus）丰度显著高于HC组。

2. 2.

   临床特征关联：尽管三组人口学特征相似，但PPn和CPn患者合并症、免疫抑制及既往感染史更为常见。

结论与意义：

该研究首次系统比较了PPn与CPn的NM特征，证实特定菌属（如链球菌）的增殖可能与细菌性肺炎的进展密切相关。这一发现为未来开发基于微生物群的诊断标志物和干预策略提供了理论基础，例如通过调控NM组成预防重症感染。此外，研究强调了健康成人NM基线数据的重要性，为区分致病性定植与共生状态建立了参考框架。未来研究可进一步探索NM与宿主免疫互作的分子机制，以优化呼吸道感染的精准管理。