综述:合成生物学工具在改善人乳成分生产中的开发与应用

【字体: 时间:2025年08月16日 来源:Techniques and Innovations in Gastrointestinal Endoscopy 0.9

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  这篇综述系统阐述了合成生物学工具(CRISPR-Cas、GEMs、基因电路等)在构建微生物细胞工厂生产人乳成分(HMOs、乳铁蛋白、DHA等)中的前沿进展,重点探讨了基因编辑技术、代谢网络模型和动态调控策略如何突破传统生产瓶颈,为婴幼儿配方食品的精准营养设计提供新范式。

  

基因编辑工具:从传统到创新的突破

传统基因编辑依赖同源重组(HR)和λ-red系统,而新型CRISPR-Cas技术通过Cas9/dCas9/nCas9实现精准编辑。CRISPR-Cas12(Cpf1)因其粘性末端和低脱靶效应成为新宠,而碱基编辑器(CBEs/ABEs)和Prime Editing则能实现单碱基修改。值得注意的是,非模式菌株如链霉菌仍依赖传统HR工具,凸显技术适配性的挑战。

代谢模型与AI:智能驱动的细胞工厂设计

基因组尺度代谢模型(GEMs)如iML1515和Yeast 9通过动态通量平衡分析(FBA)预测关键代谢节点。机器学习(ML)通过β-VAE等算法解析多组学数据,例如GPT-4加速了耶氏酵母的代谢路径挖掘。混合模型成功将色氨酸产量提升3倍,但AI预测精度仍需提高。

基因电路:动态调控与高通量筛选的利器

生长解耦电路(如群体感应QS系统)和反馈环路能平衡细胞生长与产物合成。生物传感器(如基于glmS核酶的RNA传感器)将代谢物浓度转化为荧光信号,实现2'-FL(2'-岩藻糖基乳糖)的高通量筛选。近期研究通过温度响应电路使2'-FL产量提升159.5%,而乳糖响应电路则优化了葡萄糖底物利用。

HMOs生产:从克级到百升级的飞跃

2'-FL和3-FL通过FutC/FutA转糖基酶合成,最高效价分别达121.9 g/L和52.1 g/L。唾液酸化乳糖(3'-SL/6'-SL)依赖α-2,3/2,6-唾液酸转移酶,通过UDP-GlcNAc途径实现56.8 g/L产量。核心结构LNT和LNnT经lgtA/lgtB修饰后,在1000L反应器中突破107.4 g/L,其免疫调节功能为婴儿配方开发提供新思路。

乳蛋白与功能脂质:细胞工厂的绿色革命

乳铁蛋白(HLF)在毕赤酵母中达5.4 g/L,比传统畜牧减少87%土地使用。DHA通过Schizochytrium的PKS途径实现17.01 g/L,而Mortierella alpina生产的ARA(4.4 g/L)成为FDA认证的神经发育营养素。

维生素合成:从前体到活性形式的转化

β-胡萝卜素在解脂耶氏酵母中创39.5 g/L纪录,经RALPH酶转化为视黄醇(5.4 g/L)。维生素D3前体7-DHC通过改造酵母甾醇通路达5.1 g/L,紫外转化后满足婴幼儿骨骼发育需求。

挑战与展望:合成生物学的未竟之路

AI预测准确性、非宿主基因编辑工具开发、产业级产量提升和生物安全性(如脑膜炎球菌基因的应用)仍是关键瓶颈。未来需建立跨学科标准,推动合成生物学从实验室走向产业化。

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