人类肠道与肝细胞转录组学基准揭示6PPD-醌的健康风险阈值

【编辑推荐】本研究采用TPD-seq（转录组学基准剂量）工作流，首次在人类Caco-2（肠道）和HepG2（肝脏）细胞中建立6PPD-醌的毒性阈值（tPOD 0.36-104 μg/L），发现SLC5A3/DKK1等关键基因及代谢通路异常，为这种轮胎衍生污染物的健康风险评估提供定量与机制双维度数据。

　　

Highlight

这项研究通过TPD-seq工作流程，高效地获取了与人类健康风险评估相关的定量和机制数据。

Discussion

随着对6PPD-醌可能对生态健康和人类健康造成风险的担忧日益增加（Brinkmann等，2022；EPA，2024；Fang等，2024），快速获取与风险评估相关的定量数据以及有助于理解目标物种潜在作用机制的信息，对于决策者来说变得至关重要。通过TPD-seq工作流程，我们在此提供了细胞毒性数据、tPOD值以及差异表达基因（DEG）和通路列表，这些数据来自两种人类细胞系（Caco-2和HepG2）暴露于6PPD-醌的实验。

CRediT authorship contribution statement

Ke Xu：撰写-评审和编辑，撰写-初稿，可视化，方法论，调查，形式分析，数据管理。

Krittika Mittal：撰写-评审和编辑，撰写-初稿，可视化，方法论，调查，形式分析，数据管理。

Niladri Basu：撰写-评审和编辑，监督，资源，项目管理，方法论，资金获取，概念化。

Uncited references

Armitage等，2021

De Plexer Mahoney等，2022

Declaration of competing interest

作者声明，他们没有已知的可能影响本工作报告的竞争性财务利益或个人关系。

Acknowledgements

我们要感谢Jenny Eng的行政支持，以及QIAGEN的Sam Rulli博士和麦吉尔大学Jianguo（Jeff）Xia博士实验室的技术支持。我们感谢加拿大环境与气候变化部的Peng Liu博士开发了Deplexer。本研究的资金由Génome Québec的基因组整合计划、加拿大研究主席计划和NSERC发现资助计划提供。