综述:mTOR信号通路调控转录组可塑性的研究进展

【字体: 时间:2025年08月16日 来源:Experimental & Molecular Medicine 9.5

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  这篇综述深入探讨了mTOR(雷帕霉素靶蛋白)信号通路通过调控选择性剪接(alternative splicing)和选择性多聚腺苷酸化(APA)等机制影响转录组可塑性的最新进展,揭示了其在细胞代谢、疾病(如癌症和神经退行性疾病)中的关键作用,为靶向治疗提供了新视角。

  

哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)通路及其在人类疾病中的相关性

mTOR是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,通过两种复合物mTORC1和mTORC2调控细胞生长、代谢和存活。mTORC1由mTOR、Raptor和mLST8组成,对雷帕霉素敏感,主要促进蛋白质合成和脂质合成,同时抑制自噬。其活性受氨基酸、生长因子和能量状态调控。mTORC2包含mTOR、Rictor和mLST8,对雷帕霉素不敏感,主要调控细胞存活和细胞骨架组织,通过磷酸化AKT(Ser473)增强其下游信号。

上游调控因子如PI3K-AKT通路和AMPK通过感知营养和能量状态调节mTOR活性。mTORC1通过磷酸化4E-BP1和S6K1促进蛋白质合成,尤其是含有5'-TOP结构的mRNA翻译。此外,mTORC1还调控脂质代谢和血管生成,而mTORC2参与葡萄糖稳态和胰岛素信号。

mTOR信号异常与多种疾病相关。在癌症中,PI3K-AKT-mTOR通路突变导致细胞增殖和存活增强;在代谢疾病中,mTORC1过度激活引发胰岛素抵抗;在神经退行性疾病中,mTOR失调与β-淀粉样蛋白和α-突触核蛋白的积累有关。

通过选择性剪接和多聚腺苷酸化实现的转录组可塑性

转录组可塑性通过选择性剪接和APA机制显著增加蛋白质组的多样性。选择性剪接通过可变外显子组合生成不同mRNA亚型,其调控依赖于剪接因子(如SR蛋白和hnRNP)与顺式元件(如5'剪接位点和分支点)的相互作用。剪接体(由U1、U2等snRNP组成)动态识别这些元件完成剪接。常见的剪接类型包括外显子跳跃、内含子保留和可变5'/3'剪接位点选择。

APA则通过选择不同的多聚腺苷酸化位点产生不同长度的3'-UTR或截短的mRNA。3'-UTR APA影响mRNA稳定性、定位和翻译效率,而内含子APA可能导致功能缺失的截短蛋白。两种机制均受CPSF和CstF等因子调控,并与剪接竞争相同的pre-mRNA底物。

这些过程的异常与疾病密切相关。例如,癌症中3'-UTR缩短导致MYC等癌基因逃避miRNA调控;神经退行性疾病中APA改变APP等基因的表达;肌营养不良中内含子APA产生功能缺陷的肌营养不良蛋白。

mTOR协调的转录组可塑性及其在病理机制中的相关性

研究发现mTOR通过调控RNA加工因子(如CPSF6和U2AF1)影响APA和剪接模式。mTORC1激活时,3'-UTR APA普遍缩短,增强翻译效率;而内含子APA则呈现基因特异性变化,可能通过截短蛋白域调控功能。例如,在肿瘤中,mTOR驱动的内含子APA可激活促癌激酶或抑制抑癌激酶。

在剪接调控中,mTOR通过SRPK2磷酸化SR蛋白,促进脂质生成相关基因的剪接;而mTORC1-S6K1信号通过U2AF1亚型(如U2AF1a)调控5'-UTR剪接,影响翻译起始。此外,剪接保真度下降(如rnpm-6突变)可通过保留egl-8内含子抑制mTOR信号,延长寿命。

结论与未来挑战:mTOR调控转录组可塑性的蛋白质组学视角

尽管人类基因组仅含约2万个基因,转录组可塑性通过可变剪接和APA极大地扩展了功能多样性。mTOR不仅调控蛋白质合成,还通过RNA加工重塑转录组,但其在特定生物学背景下的功能仍需系统研究。未来需结合长读长测序和单细胞技术解析异构体动态,开发靶向干预策略。

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