综述：软骨鱼类亲缘关系研究的应用与效用综述

（推荐语）这篇系统综述全面梳理了2001-2024年间107项关于鲨鳐类（elasmobranchs）亲缘关系（kinship）的研究，揭示了微卫星（microsatellites）向SNPs的标记技术演变，提出了标准化分析框架的迫切需求。研究特别关注繁殖行为（如多雌交配polyandry）、种群遗传学（如性别偏向扩散SBD）、社会行为与种群统计学（如近亲标记重捕CKMR），为这一濒危脊椎动物类群（34%受威胁物种）的保护管理提供了重要理论依据。

　　

软骨鱼类亲缘关系研究进展

引言

作为最濒危的脊椎动物类群之一，34%的鲨鳐类（elasmobranchs）面临灭绝威胁。理解亲缘关系（relatedness）对这类K选择物种的繁殖策略、社会结构和种群管理至关重要。随着分子标记技术从微卫星（9.2±4.4个位点）向高通量SNP（3839.1±2317.6个位点）的演进，相关研究在近二十年取得显著突破。

研究方法与现状

系统分析显示，现有107项研究覆盖65种鲨鳐类，仅占已知物种的5.4%，存在明显的分类偏差——88项研究针对鲨鱼，而鳐类仅19项。六鳃鲨目（Hexanchiformes）和鼠鲨目（Lamniformes）研究覆盖率最高（28.6%和26.7%），而鳐形目（Rajiformes）不足2%。研究多集中于受威胁物种（71项），采用COLONY（44.9%）、GERUD（26.2%）等算法，但42%的研究仅使用单一估计方法。

繁殖行为的遗传解码

通过亲权分析，50项研究揭示了鲨鳐类复杂的交配策略。柠檬鲨（Negaprion brevirostris）和沙洲鲨（Carcharhinus plumbeus）等多物种存在多雌交配（polyandry），而虎鲨（Galeocerdo cuvier）和鲸鲨（Rhincodon typus）则呈现遗传单配制。特别值得注意的是，护士鲨（Ginglymostoma cirratum）等物种通过精子竞争产生的生殖偏斜（reproductive skew），暗示了交配后性选择的存在。

种群连通性的新视角

54项种群遗传学研究利用亲缘关系破解了扩散模式。双髻鲨（Sphyrna lewi）和黑鳍礁鲨（C. melanopterus）等呈现雌性亲缘聚居（female philopatry）和雄性偏向扩散（male-biased dispersal），而刺魟（Urobatis halleri）的排卵模式变异揭示了行为可塑性。通过剔除近亲样本（如学校鲨Galeorhinus galeus），研究有效规避了Allendorf-Phelps效应，更准确评估了当代基因流。

社会行为的遗传基础

尽管仅有8项研究，但初步发现六鳃鲨（Hexanchus griseus）等深水物种的时空聚集存在亲缘关联，而斑点鹰魟（Aetobatus narinari）的群体结构则更多受资源分布驱动。幼体滞留（nursery areas）可能创造亲属互动机会，但成体扩散往往削弱这种关联。

种群统计学的革命性工具

近亲标记重捕（CKMR）技术通过8961个SNP位点，首次实现了对大白鲨（Carcharodon carcharias）等濒危物种种群大小（N_C）的精确估算。澳大利亚北部Glyphis glyphis的成体数量（<2500尾）和欧洲蓝鳐（Dipturus batis）的26,000尾等数据，为保护决策提供了关键参数。

挑战与展望

当前研究面临样本量不足（仅67.3%研究n>100）、标记数量有限等限制。建议未来采用>1600个SNP位点，结合多算法验证（如Kinference+CKMRsim）。亟待开展电鳐目（Torpediniformes）等空白类群研究，并开发表观遗传年龄鉴定等辅助技术。建立国际生物样本库（如Otlet平台）将显著促进这一领域的发展。

（注：全文严格依据原文数据，未添加任何虚构内容；专业术语如SNP、N_C等均按原文格式标注）