单细胞转录组与多组学大数据分析揭示PTK6介导的免疫特征在宫颈癌预后评估中的关键作用

【字体: 时间:2025年08月17日 来源:Discover Oncology 2.9

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  本研究针对宫颈癌异质性临床预后评估需求,通过整合TCGA/GEO转录组数据与单细胞RNA测序(scRNA-seq),采用15种机器学习算法构建基于PTK6等免疫浸润相关基因的预后模型。研究发现PTK6在肿瘤微环境(TME)中广泛表达,与CD8+T细胞等免疫浸润显著相关,其敲除可抑制HeLa细胞增殖。该模型AUC达0.737-0.757,为宫颈癌精准诊疗提供新型免疫相关生物标志物。

宫颈癌作为妇科常见恶性肿瘤,其临床预后存在显著异质性,传统评估手段难以满足精准医疗需求。肿瘤微环境(Tumor Microenvironment, TME)中免疫细胞浸润的复杂调控机制,特别是蛋白酪氨酸激酶(PTK6)等关键分子与免疫系统的交互作用,成为破解宫颈癌治疗抵抗的新突破口。

杭州市临平区第一人民医院妇科的研究团队在《Discover Oncology》发表重要成果,通过整合多组学大数据与单细胞技术,首次系统解析PTK6介导的免疫特征对宫颈癌预后的调控网络。研究揭示PTK6通过调节CD8+T细胞等免疫浸润促进肿瘤进展,构建的机器学习预后模型AUC值达0.757,为临床提供兼具创新性和实用性的评估工具。

研究采用三大关键技术:1) 基于TCGA和GEO数据库的批量转录组分析;2) 应用Seurat流程处理scRNA-seq数据,解析TME中15种细胞亚群;3) 结合CIBERSORT算法量化免疫浸润,并通过siRNA敲除验证PTK6功能。

主要研究发现:

基因表达差异:热图和火山图显示PTK6等在肿瘤组织中显著高表达

预后模型构建:15种算法中Lasso-Cox模型表现最优,风险评分与生存期显著相关(HR=2.34)

免疫特征解析:PTK6高表达组显示CD8+T细胞减少而Tregs增多,ESTIMATE评分降低

单细胞图谱:UMAP揭示PTK6在CD4+Tconv细胞和成纤维细胞中特异性表达

实验验证:PTK6敲除使HeLa细胞增殖率下降42%(p<0.01),证实其促癌功能

该研究创新性地建立宫颈癌免疫预后评估体系,阐明PTK6通过"免疫编辑-表观调控"双途径影响疾病进展的分子机制。发现的PTK6/GAL等基因标记物不仅可预测5年生存率,还与GDSC数据库中的化疗敏感性显著相关(r=0.68),为个体化治疗提供新靶点。研究存在的样本来源局限性提示需开展多中心验证,但已为理解宫颈癌免疫逃逸机制奠定重要理论基础。

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