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USP8通过去泛素化增强NSUN4稳定性并促进DHCR24的m5C甲基化驱动肺鳞癌进展
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月17日 来源:Cell Reports 6.9
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本研究揭示了USP8通过去K11多聚泛素化稳定RNA甲基转移酶NSUN4,进而介导DHCR24 mRNA的m5C修饰促进肺鳞癌(LUSC)进展的分子机制。研究人员通过RNA-BisSeq筛选出DHCR24等关键靶基因,证实NSUN4/YBX1通过m5C依赖性机制增强mRNA稳定性,为LUSC表观遗传治疗提供新靶点。
肺鳞状细胞癌(LUSC)作为肺癌主要亚型,其治疗面临巨大挑战——缺乏有效靶向药物,患者5年生存率不足20%。这种困境背后是LUSC特有的表观遗传异质性,尤其是RNA修饰调控机制尚未阐明。在众多RNA修饰中,5-甲基胞嘧啶(m5C)虽与m6A齐名,但其在癌症中的作用犹如"暗物质",相关调控网络和效应机制长期空白。
同济大学医学院附属同济医院胸外科周永新(Yongxin Zhou)团队在《Cell Reports》发表的研究,首次揭示USP8-NSUN4-DHCR24轴通过m5C甲基化驱动LUSC进展的完整机制。研究人员发现NSUN4在LUSC组织中异常高表达且与不良预后相关,通过构建稳定敲低细胞模型,结合RNA-BisSeq和MeRIP-qPCR技术,鉴定出DHCR24等14个关键m5C修饰靶基因。进一步实验证明USP8通过特异性去除NSUN4的K11连接型泛素链维持其蛋白稳定性,而NSUN4与YBX1协同作用于DHCR24 mRNA 3'UTR的m5C位点,显著延长其半衰期并激活PI3K-AKT致癌通路。
关键技术方法包括:1)TCGA数据库生物信息学分析;2)80例LUSC患者组织芯片免疫组化;3)RNA-BisSeq全转录组m5C测序;4)K11/K48/K63等多类型泛素化修饰检测;5)DHCR24 3'UTR荧光素酶报告系统验证。
主要研究结果:
NSUN4促进LUSC细胞增殖
通过shRNA敲低NSUN4显著抑制NCI-H520和NCI-H226细胞增殖(CCK-8和克隆形成实验),而在正常肺上皮细胞BEAS-2B中过表达无促增殖效应。

USP8稳定NSUN4蛋白
免疫共沉淀证实USP8与NSUN4直接互作(结合域165-352aa)。蛋白酶体抑制剂MG132处理显示,USP8通过去K11泛素化延长NSUN4半衰期(CHX追踪实验从8h延长至16h)。
m5C修饰图谱特征
RNA-BisSeq发现NSUN4敲除导致1,102个m5C峰消失(|log2FC|>1),KEGG分析富集于PI3K-AKT等致癌通路。dot blot证实USP8敲除使全局m5C水平降低40%。
DHCR24调控机制
RIP-qPCR显示NSUN4/YBX1共同结合DHCR24 mRNA。突变m5C位点(DHCR24-MUT)完全消除报告基因活性,且使mRNA半衰期从9h缩短至3h(放线菌素D实验)。
动物模型验证
DHCR24回补可逆转NSUN4敲低导致的移植瘤体积缩小(从502mm3恢复至785mm3),Western blot显示p-PI3K/p-AKT信号同步恢复。
这项研究首次阐明USP8-NSUN4-YBX1级联反应通过m5C表观调控促进LUSC进展的分子框架。特别值得注意的是:1)发现K11连接型泛素化是调控RNA修饰酶稳定性的新机制;2)揭示DHCR24作为胆固醇代谢酶具有m5C依赖性致癌功能;3)提供NSUN4/DHCR24作为LUSC预后标志物的临床证据。尽管存在E3连接酶未鉴定等局限,该研究为开发靶向RNA表观遗传的小分子抑制剂奠定理论基础,也为克服LUSC异质性治疗困境提供新思路。