染色体水平的美女蛇(Elaphe taeniura)基因组组装与注释揭示游蛇科物种进化特征

【字体: 时间:2025年08月17日 来源:Journal of Heredity 2.5

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  研究人员通过整合PacBio HiFi长读长测序和Hi-C染色质构象捕获技术,成功构建了游蛇科代表物种美女蛇(Elaphe taeniura)的染色体级别参考基因组(1.62 Gb,scaffold N50 206.4 Mb)。该研究填补了游蛇科基因组资源空白,鉴定出22,246个蛋白编码基因,通过比较基因组学揭示了染色体融合/分裂事件,为蛇类分类学、保护生物学及进化研究提供了重要分子基础。

  

游蛇科(Colubridae)作为蛇类最大物种支系之一,其代表物种美女蛇(Elaphe taeniura)凭借广泛分布和强适应性成为理想研究对象。研究团队采用第三代测序技术(PacBio HiFi)结合染色质空间构象捕获(Hi-C)技术,成功绘制该物种染色体级别基因组图谱——总长1.62 Gb,scaffold N50达206.4 Mb,最长scaffold突破344.4 Mb,BUSCO评估显示98.2%的基因完整性。

基因组注释鉴定出22,246个蛋白编码基因,通过与三个近缘物种比较发现高度保守的基因共线性,同时检测到若干染色体融合(fusion)和分裂(fission)的进化事件。该高质量参考基因组的建立,不仅为解析游蛇科物种的适应性进化机制提供分子框架,更对爬行动物保护遗传学和生物多样性研究具有里程碑意义。

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