基于计算生物学方法的星形诺卡菌NCTC11293假设蛋白功能注释与新型药物靶点发现

这篇研究通过in silico（计算机模拟）方法对星形诺卡菌NCTC11293的1130个假设蛋白（HPs）进行功能注释，鉴定出59个关键蛋白，其中醛缩酶1-差向异构酶（A1-E）被确立为潜在治疗靶点。通过结构虚拟筛选（SBVS）、分子对接（?8.5 kcal/mol）、MMGBSA结合能分析（?59.93 kcal/mol）及分子动力学模拟（MDS），从IMPPAT数据库筛选出5种天然化合物，其药代动力学特性符合Lipinski五规则，为诺卡菌病治疗提供了新策略。

　　

亮点

本研究首次通过计算生物学手段系统注释星形诺卡菌的假设蛋白，锁定A1-E为关键靶点，并发现5种高结合活性天然化合物，为对抗耐药性诺卡菌感染提供创新解决方案。

讨论

新型药物靶点的发现及其生物学功能解析是开发有效疗法的核心。计算生物学在表征假设蛋白（HPs）方面展现出独特优势，此类蛋白占细菌基因组的显著比例。类似策略已成功应用于肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）和地衣芽孢杆菌（Bacillus paralicheniformis）等病原体研究。

结论

生物大分子在细胞进程中起基础作用，蛋白功能注释对理解其生物学意义至关重要。本研究从星形诺卡菌中鉴定出59个必需假设蛋白，其中A1-E（WP_019046482.1）因其在病理生理中的多重功能成为最具潜力的抗菌靶点，为应对抗生素耐药危机提供了新思路。

（注：翻译部分保留原文专业术语如in silico、HPs等，并采用动态表述如"锁定""高结合活性"增强可读性，同时严格遵循上下标规范如kcal/mol。）