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综述:DataMaze:莫里斯水迷宫实验的开源方法与数据存储库
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月18日 来源:Neuroscience & Biobehavioral Reviews 7.6
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这篇综述推荐建立首个莫里斯水迷宫(MWM)标准化数据库DataMaze,整合近5000篇文献的装置参数(如水池直径、平台深度)和任务指标(如训练次数、探测试验延迟),提出DataMaze_Index2024和性能优化指数PO_Index,通过大数据分析揭示大鼠学习速率显著高于小鼠(p<0.001),为神经行为学研究提供FAIR(可查找、可访问、可互操作、可重用)原则下的实验设计基准与二次分析平台。
DataMaze:重塑行为神经科学研究的标准化实践
Abstract
行为神经科学领域长期面临实验参数(如装置尺寸、训练间隔)不统一导致的结论异质性问题。DataMaze项目通过系统分析4926篇莫里斯水迷宫(MWM)文献,构建首个开源数据库,收录装置规格(水池直径、水温等)、任务参数(训练次数、探测试验延迟等)及行为数据(逃避潜伏期、目标象限停留时间)。研究提出DataMaze_Index2025量化实验参数与文献基准的偏离度,并开发性能优化指数PO_Index(基于水池直径、水温等4个关键参数),证实控制组学习速率在参数接近文献中位数时最优(p<0.001)。
Introduction
作为空间记忆研究的金标准,MWM自1981年问世以来已有超13,000篇相关论文,但装置参数差异导致结果可比性受限。例如大鼠实验水池直径中位数(150cm)显著大于小鼠(120cm),平台深度也存在物种差异(大鼠1.5cm vs 小鼠1cm)。这种变异可能影响学习速率(大鼠-0.39/天 vs 小鼠-0.24/天)和长期记忆表现(目标象限停留时间44% vs 39%)。
Methods
团队通过PubMed检索10,000+文献,经21名研究人员人工标注形成初始数据集。采用三重质控:逻辑校验(如无探测试验则剔除相关字段)、离群值检测(如水深>1米标记复核)、字段验证(强制数值/分类结构)。行为数据通过WebPlotDigitizer从450+篇文献图像提取,最终形成包含逃避潜伏期衰减率和探测试验表现的标准化数据集。
Results
3.1 关键参数分布
物种差异显著:大鼠实验更倾向短训练间隔(中位数4分钟 vs 小鼠10分钟),且多采用4次/日训练(小鼠3.92次)。水温在23°C形成明显峰值(标准差±2.6°C),而探测试验时长60秒占比最高(占全部实验的52%)。
3.2 性能优化指数
PO_Index分析显示,当pool直径z分数=0时学习速率最佳(?=-0.11,p<0.001)。四项参数(直径、水温、单日训练次数、间隔时间)的绝对z分均值每增加1单位,学习效率下降27%(r=-0.27)。
3.3 次级分析案例
以东莨菪碱研究为例,混合效应模型揭示该药物显著延长逃避潜伏期(?=0.095,p=0.002),并减弱训练效果(交互作用?=0.059,p<0.001)。探测试验时长与目标象限停留时间呈负相关(rs=-0.19),提示60秒可能是记忆检索的优化时长。
Discussion
DataMaze通过三重革新推动领域发展:1) 提供装置参数选择的量化依据;2) 建立行为表现的先验分布(如控制组逃避潜伏期衰减率95%CI[-0.32,-0.16]);3) 支持FAIR原则下的数据共享。未来将通过自动化文本挖掘持续更新,并扩展至巴恩斯迷宫(Barnes maze)等行为范式。当前局限在于仅整合实验级(非个体级)数据,未来将鼓励研究者提交原始数据以支持多层建模。
Author Notes
作者顺序按数据贡献度排列,特别致谢21人研究团队的文献标注工作。所有数据已在OSF平台开源(osf.io/tjc5s),欢迎研究者通过BalciDataMaze@gmail.com提交新数据。
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