化学诱导基因表达全景图谱：基于93,664次扰动的高通量解析与HiMAP-seq技术突破

本研究通过HTS2和新型HiMAP-seq技术，系统解析13,221种化合物在2种人源细胞系中引发的3,407个关键基因表达事件（共319,045,108数据点），成功构建化学诱导基因签名（CIGS）数据库。该资源不仅能阐明木犀草素等小分子作用机制，还可识别铁死亡抗性等细胞状态，为药物发现提供全新维度。数据集已开放访问：https://cigs.iomicscloud.com/

　　

科研团队重磅发布化学诱导基因表达（CIGS）全景数据库，这项突破性工作如同给细胞安装了"化学监控摄像头"——通过革命性的高度多重平行测序技术（HiMAP-seq），实现了单次实验同时捕获数千样本中数千基因的表达指纹。该研究犹如绘制了化学扰动下的基因"应激反应地图"，涵盖13,221种化合物在人类细胞中触发的3407个功能基因的3亿余次表达事件。

技术亮点在于将新型HiMAP-seq与传统高通量测序筛选（HTS²）对标验证，证明其可像RNA测序般精准，却具备"化学条形码"式的样本混池检测能力。研究人员像"基因侦探"般利用该技术破译了木犀草素（ligustroflavone）等神秘小分子的作用密码，更捕捉到细胞抵抗铁死亡（ferroptosis）等罕见状态的关键信号。

这个活细胞"化学-基因"交互百科全书已开放访问，为药物重定位和毒理预测提供了前所未有的解码器。特别值得注意的是，其采用的HiMAP-seq技术犹如基因检测领域的"高通量CT扫描仪"，使大规模化合物筛选效率产生指数级提升。