2019-2023年伊朗口蹄疫病毒分子流行病学研究：新型SA-2018谱系的发现与疫苗有效性评估

本研究针对伊朗口蹄疫病毒(FMDV)持续流行问题，通过VP1基因序列分析揭示了2019-2023年三种血清型(O/A/Asia 1)的流行特征。首次报道了O/ME-SA/SA-2018谱系的入侵，证实ANT-10和PUN-16亚谱系在PanAsia-2谱系中的主导地位，同时发现疫苗接种动物仍存在高阳性率现象，为疫苗更新和防控策略优化提供了关键依据。

　　

研究背景与意义

口蹄疫(FMD)作为最具经济破坏性的跨境动物疫病，每年在全球造成约2000亿美元损失。伊朗作为中东地区畜牧业大国，自1951年首次报道疫情以来，长期受O、A和Asia 1三种血清型困扰。尽管实施了三价灭活疫苗接种计划，2014-2015年仍暴发1381起疫情，暴露出疫苗保护力不足、病毒变异频繁等核心问题。更严峻的是，相邻的巴基斯坦、阿富汗等国持续输出新型病毒谱系，使得伊朗成为FMDV变异的"熔炉"。

为破解这一困局，德黑兰大学兽医学院微生物与免疫学系联合伊朗Razi疫苗与血清研究所的研究团队，开展了为期四年的分子流行病学监测。这项发表在《Scientific Reports》的研究，不仅首次捕获了SA-2018谱系在中东地区的扩散证据，更揭示了疫苗毒株与流行毒株间高达24个氨基酸的抗原差异，为区域防控提供了关键科学依据。

关键技术方法

研究团队于2019-2023年采集伊朗4省98份疑似样本，通过RT-PCR进行血清分型，对阳性样本扩增VP1基因并测序。采用MEGA7软件构建系统发育树，结合GTR模型分析遗传距离。重点比对了现场毒株与疫苗株（IR/P50/2016等）的VP1氨基酸变异，特别关注抗原位点RGD基序的保守性。

主要研究结果

FMD病毒检测与血清分型

在86.73%的阳性样本中，血清型O占64.70%（ANT-10/QOM-15/PUN-16亚谱系），A型占31.80%（Iran-05/FAR-11谱系），Asia 1型仅3.50%（Sindh-08谱系）。

SA-2018谱系的发现

UT-Otarod 2008毒株（OR991332）被确认为伊朗首例SA-2018谱系病例，与印度2021年毒株（OQ847022.1）仅存在A13S/A142T两个氨基酸差异。该谱系与本地疫苗株IR/P50/2016的VP1相似性仅82%，

疫苗匹配性危机

• O型：现场毒株与疫苗株VP1差异达10-24个氨基酸，关键抗原位点R45K/R141H变异普遍

• A型：疫苗株IRN/23/2015出现RGD→RDD突变，而现场株UT-Otarod 9134更出现WGD罕见变异

• Asia 1型：虽疫苗保护较好，但现场毒株存在A24/R27位点缺失

讨论与展望

该研究揭示了三个重要流行病学特征：一是SA-2018谱系从印度经阿联酋向中东扩散的新路径；二是ANT-10亚谱系持续十年的地域性优势可能被打破；三是现行疫苗对O型变异株的保护缺口高达18%。

研究人员建议：1）立即更新疫苗株，优先纳入SA-2018代表毒株；2）加强阿富汗-巴基斯坦边境检疫；3）建立VP1抗原位点实时监测网络。这些发现不仅为伊朗，更为整个中东Pool 3流行区的科学防控提供了分子层面的决策依据。