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高碳酸氢钠胁迫下草鱼鳃与肝脏转录组调控机制解析及其耐盐碱分子育种启示
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月20日 来源:Marine Biotechnology 2.8
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为探究草鱼应对高浓度NaHCO3胁迫的分子机制,研究人员通过RNA-seq技术对30 mmol/L处理组与对照组的鳃、肝组织进行转录组分析。研究发现鳃组织1223个、肝脏439个差异基因(DEGs),GO分析显示蛋白水解、ATP结合及脂代谢等过程参与响应,KEGG通路揭示免疫信号激活与能量代谢提升是关键抗逆机制。该研究为耐盐碱草鱼品种选育提供重要理论支撑。
这项研究通过高通量测序(RNA-seq)技术,深入解析了草鱼在30 mmol/L NaHCO3高碱胁迫下鳃和肝脏组织的转录组特征。实验构建12个测序文库(鳃、肝组织各6个),获得鳃组织41.86 GB、肝脏41.49 GB高质量数据。研究发现鳃组织出现1223个显著差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs),肝脏则检测到439个DEGs。
功能注释(GO)分析表明,草鱼通过精密调控蛋白水解过程、ATP结合活性以及脂质代谢网络等生物学过程来应对碱性胁迫。通路(KEGG)分析更揭示出,机体通过显著激活免疫相关信号通路(如Toll样受体通路)构建防御体系,同时能量代谢水平的提升为抗逆过程提供了"能量货币"支持。
该研究首次系统描绘了草鱼在高碱环境中的分子适应蓝图,其发现的枢纽基因和关键通路不仅为理解鱼类耐盐碱机制提供了新视角,更为分子标记辅助育种(MAS)技术培育耐盐碱草鱼新品种奠定了理论基础。这些发现对发展盐碱水域养殖产业具有重要实践价值,也为脊椎动物环境适应机制研究提供了新模式。
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