综述:实用可识别性的不同分类方法

【字体: 时间:2025年08月20日 来源:Current Opinion in Toxicology 3.6

编辑推荐:

  这篇综述深入探讨了系统生物学中常微分方程(ODE)模型的实用可识别性(Practical Identifiability)分析方法,区分了基于敏感度(Sensitivity)和置信区间(Confidence Interval)的两类评估标准,强调需通过术语明确方法学差异,并提出参数应依据所用方法分别称为"先验/后验敏感"或"有限可识别"。

  

实用可识别性的多维解析

引言

计算能力的进步推动数学建模在系统生物学和医学中的应用。机制模型(Mechanistic Models)需通过可识别性验证才能确保参数估计的可靠性。结构可识别性(Structural Identifiability)是模型固有属性,而实用可识别性则因定义模糊导致评估结果分歧。

定义实用可识别性

结构可识别性要求参数θi满足全局唯一性条件:模型预测轨迹y(θ)与y(θ')完全一致时必有θi=θ'i。实用可识别性则分为两类方法:

  1. 1.

    敏感度分析法

    通过敏感度矩阵S=?y/?θ评估参数影响力,需设定启发式阈值判断"先验/后验敏感"。例如,快速反应系统中若数据未覆盖动态变化时段(如饱和期观测),敏感度分析可能遗漏参数不敏感性。

  2. 2.

    置信区间法

    基于轮廓似然函数(Profile Likelihood),若参数置信区间在给定显著性水平α下无界,则判定为"非有限可识别"。典型案例显示,Michaelis-Menten模型拟合质量作用(Mass-action)数据时,Km参数仅存在下限而无上限约束。

典型非可识别性成因

数据缺陷

  • 高噪声数据(图1B)导致置信区间扩大但保持有限

  • 观测时段不当(图1C)使快速反应速率k→∞仍符合数据

模型复杂度失配

质量作用数据用Michaelis-Menten模型拟合时,虽能复现数据,但kcat与Km比值恒定导致双参数均非有限可识别(图2B)。敏感度分析对此类过参数化问题无效。

方法论价值

  • 敏感度分析适用于实验设计阶段,通过参数扫描确定关键观测窗口

  • 轮廓似然法需实测数据,能识别模型冗余机制,如Km参数在低底物浓度时的渐进等效性

结论

明确术语区分"敏感度"与"有限可识别"至关重要。前者反映模型理论特性,后者体现数据约束能力。二者结合可优化模型简化与实验设计,提升系统生物学研究的可重复性。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号