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牙齿根表面无损自动化DNA提取方法的开发及其在法医人类学中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月20日 来源:Forensic Imaging 1
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为解决骨骼遗骸DNA提取过程中样本破坏性大、伦理争议多的问题,研究人员开发了一种针对牙齿根表面牙骨质层的无损自动化DNA提取方法。通过0.5 M EDTA脱矿和自动化纯化技术,从13-19世纪考古犬齿中成功获得74%的高质量短串联重复序列(STR)分型结果。该方法避免了传统研磨、钻孔操作,显著降低污染风险,为法医鉴定和古DNA研究提供了高效、伦理合规的技术方案。
在法医人类学和考古学领域,骨骼遗骸的DNA提取长期面临两难困境:传统方法需通过破坏性研磨获取足量DNA,但伦理规范要求鉴定后的遗骸应完整归还亲属。牙齿作为最稳定的生物样本之一,其牙骨质层(cementum)虽被证实富含DNA,但现有技术仍需破坏性处理。这一矛盾在博物馆标本和战争遗骸鉴定中尤为突出,促使研究者寻求突破性解决方案。
来自斯洛文尼亚卢布尔雅那大学法医学院的Irena Zupani? Pajni?团队创新性地提出全牙浸泡式提取策略。研究选取62颗13-19世纪考古犬齿,通过化学清洗-UV消毒-EDTA脱矿-靶向裂解的组合方法,配合EZ1 Advanced XL自动化纯化系统,实现了对牙骨质层DNA的无损获取。关键创新在于利用犬齿单根结构的形态优势,仅通过液体处理完成DNA释放,样本完整性保持率达100%(如图3所示)。
技术方法核心包括:1)样本来自?rnomelj和Ljubljana两处考古遗址的62具成人骨骼犬齿;2)采用5% Alconox化学清洗与双面UV辐照去污染;3)0.5 M EDTA 37°C振荡脱矿12小时;4)G2缓冲液/蛋白酶K/DTT联合裂解体系;5)PowerQuant系统定量评估DNA降解指数(Auto/Deg ratio);6)PowerPlex ESI 17 Fast System进行STR分型验证。
研究结果部分显示:
DNA定量:80.6%样本检测到>0.5 pg/μL核DNA,Ljubljana样本降解指数(最高24)显著低于?rnomelj样本(最高58),反映地域埋藏环境差异。
STR分型:74%样本获得≥11个STR位点,其中30份为完整17个STR图谱,考古样本中罕见达到国际失踪人员委员会(ICMP)数据库录入标准。
污染控制:5份提取阴性对照(ENC)均未检出STR图谱,且所有样本STR型与消除数据库无匹配,证实方法可靠性。
组织特异性验证:13例配对颞骨岩部样本STR分型100%匹配,确认牙骨质DNA的内源性。
讨论部分强调,该方法相比传统技术具有三重优势:首先,避免物理破坏满足《人类遗骸DNA研究全球指南》的伦理要求;其次,靶向牙骨质层规避了牙髓降解问题,对长期埋藏样本更具普适性;最后,半自动化流程将操作时间缩短至24小时内,更适合法医实战。研究同时揭示,牙齿DNA保存与埋藏微环境密切关联,这解释了两处遗址样本成功率差异(?rnomelj 53% vs Ljubljana 44%)。
这项发表于《Forensic Imaging》的研究,首次实现考古牙齿STR分型与样本保全的双重目标,为战争遗骸鉴定、历史人物DNA分析开辟了新途径。其技术框架可延伸至法医齿科学领域,未来或可通过优化裂解体系应用于多根牙样本,进一步提升回收率。该成果标志着法医DNA提取技术向"无损化-自动化-伦理化"方向迈出关键一步。
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