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七棱腹海马(Hippichthys heptagonus)线粒体基因组测序及其在海龙科系统发育中的定位研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月21日 来源:Journal of Genetics 1.2
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研究人员完成了七棱腹海马(Hippichthys heptagonus)全长线粒体DNA(mtDNA)基因组测序,该16,646bp基因组包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区。通过对海龙科18属58个mtDNA蛋白编码序列进行最大似然法和贝叶斯分析,首次基于全mtDNA基因组系统解析了海龙科内各族的进化关系,证实七棱腹海马与Phoxocampus同属Leptonotini族,并支持海龙亚科和 Nerophinae亚科的单系性。该研究为海龙科系统发育研究提供了重要分子依据。
这项研究聚焦于海龙科(Syngnathidae)鱼类系统发育关系解析,研究对象是七棱腹海马(Hippichthys heptagonus)的线粒体基因组。科研人员成功测定了该物种完整的线粒体DNA(mtDNA)序列,其基因组全长16,646个碱基对(bp),具有典型的硬骨鱼类线粒体基因组结构特征:包含13个蛋白质编码基因、22个转运RNA(tRNA)基因、2个核糖体RNA(rRNA)基因以及1个控制区,其基因排列顺序和链分布模式与其他海龙科物种保持一致。
研究团队采用最大似然法(Maximum Likelihood)和贝叶斯分析(Bayesian analysis)对海龙科18个属的58条完整mtDNA蛋白编码序列进行了系统发育重建。分析结果明确支持将七棱腹海马与Phoxocampus共同归入海龙亚科(Syngnathinae)的Leptonotini族。研究还证实了Nerophinae亚科和海龙亚科的单系性,并在海龙亚科内确立了Haliichthytini、Hippocampini、Leptonotini、Solegnathini和Syngnathini五个族的单系群关系。
这项研究开创性地基于完整mtDNA基因组数据对海龙科的系统发育关系进行了全面解析,为理解这一特殊鱼类类群的进化历史提供了重要的分子系统学证据。研究结果不仅明确了七棱腹海马的分类地位,更为海龙科内各主要类群间的系统发育关系建立了可靠的分子框架。
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