软组织黏液样软骨肉瘤中继发性基因改变(Secondary Genetic Alterations)的临床预后价值研究

来自MSKCC的研究团队针对罕见软组织肉瘤——黏液样软骨肉瘤(EMC)的分子特征展开研究，通过341-505基因panel的MSK-IMPACT技术分析18例患者样本，首次系统揭示非EWSR1融合亚型更易出现继发性基因改变(SGAs)，发现TP53等基因变异与较差的无病生存期(DFS)和总生存期(OS)显著相关(p<0.05)，为这类NR4A3融合驱动肿瘤的精准诊疗提供新依据。

　　

这项关于软组织黏液样软骨肉瘤(Extraskeletal Myxoid Chondrosarcoma, EMC)的突破性研究揭示了该疾病的分子奥秘。作为一类具有独特黏液样基质的罕见肉瘤，EMC的特征性分子改变是NR4A3基因与EWSR1(78%病例)、TAF15等伙伴基因的融合事件。研究人员采用新一代测序技术(MSK-IMPACT)对20个肿瘤样本进行深度分析，发现这些肿瘤普遍具有低突变负荷(TMB 0-2)，但三分之二病例存在继发性基因改变(Secondary Genetic Alterations, SGAs)，平均每个肿瘤携带1.67个额外突变。

值得注意的是，非EWSR1融合亚型(如TAF15::NR4A3)表现出更活跃的基因组不稳定性，平均携带2.75个SGAs，显著高于EWSR1重组肿瘤的1.36个。TP53作为唯一反复出现的变异基因，在两组融合亚型中各发现1例。其他零星突变涉及细胞周期调控基因CDKN1B和端粒酶TERT等。临床数据分析显示，携带≥1个SGA的患者预后显著恶化，其无病生存期(DFS)和总生存期(OS)的p值分别达到0.022和0.014。

尽管83%患者发生远处转移，但转移风险与SGA状态无明确相关性。这项研究首次系统描绘了EMC的分子图谱，证实了除融合亚型外，SGAs可作为独立的预后指标。这些发现为理解EMC的疾病异质性和开发靶向治疗策略提供了重要线索，特别是对于侵袭性更强的非EWSR1融合亚型患者。未来需要更大规模研究来验证不同融合伙伴基因与基因组不稳定性之间的分子机制关联。