鸽子粪便微生物组的宏基因组分析:揭示微生物多样性、病原体及抗生素抗性基因

【字体: 时间:2025年08月21日 来源:Antonie van Leeuwenhoek 1.8

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  来自马来西亚拉曼大学的研究人员通过宏基因组测序技术,对校园内273份鸽子粪便样本进行微生物组分析,揭示了以假单胞菌门(Pseudomonadota)和芽孢杆菌门(Bacillota)为主的菌群结构,鉴定出38种潜在人类病原体(占5.11%)和19种抗生素抗性基因(AMR),同时发现鸽圆环病毒(73.23%)和轮状病毒(80.43%)等禽类病毒。该研究为公共场所禽类管控提供了重要科学依据。

  

岩鸽(Columba livia)粪便中蕴藏着复杂的微生物世界。研究人员采用鸟枪法宏基因组测序技术,对马来西亚拉曼大学金宝校区采集的273份新鲜样本展开深度解析。通过Illumina NovaSeq 6000平台测序和CZ ID平台分析,发现微生物群落以细菌(84.44%假单胞菌门Pseudomonadota和15.26%芽孢杆菌门Bacillota)为主导,这种5.5倍的丰度差异暗示鸽群可能存在肠道健康问题。

令人警惕的是,5.11%的细菌群落(含38个物种)被鉴定为人类潜在病原体,主要威胁肠道和呼吸系统。19个AMR基因的检出尤其值得关注,这些基因集中在志贺氏菌(Shigella)、沙门氏菌(Salmonella)和克雷伯菌(Klebsiella)中,预示着多重耐药菌的进化风险。

病毒组分析显示,免疫抑制性鸽圆环病毒(DNA病毒,73.23%)与大肠杆菌(E. coli)、肺炎克雷伯菌(K. pneumoniae)及轮状病毒的继发感染存在关联。高检出率的轮状病毒(RNA病毒,80.43%)更是人禽共患的肠道疾病元凶。真菌群落中,哈萨克斯坦酵母(Kazachstania, 94.11%)和阿萨希毛孢子菌(Trichosporon asahii, 3.56%)两种人类致病菌的共存,进一步凸显了公共卫生风险。

这项研究敲响警钟:餐饮区、通风系统和医疗场所的鸽子防控刻不容缓。

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