经济高效的RNA提取替代方案：基于通用硅胶柱的SARS-CoV-2检测优化策略

（编辑推荐）本研究针对SARS-CoV-2（SC2）诊断中试剂短缺问题，评估四种非提取方案并提出基于通用硅胶柱的经济型RNA提取法。该方案与标准手动/自动化提取效率相当（ANOVA，F=0.69，p=0.415），平均Ct值仅相差1个循环，为资源受限的公共卫生实验室提供可靠替代方案。

　　

Highlight

非提取方案对比

文献综述发现四种免RNA提取的SC2检测方法。我们使用15份新鲜鼻咽拭子样本，对比了直接上样（No treatment）、热灭活、蛋白酶K处理（Proteinase-K）和商用QIAprep & Amp Viral RNA UM试剂盒的效果，所有方法均基于WHO推荐的SC2检测标准。

结果

通过对比标准手动提取（Qiamp Viral RNA mini kit）、四种非提取方案及本研究的改良方案发现：热灭活法（Smyrlaki et al.方案）导致所有样本RT-PCR无信号；其余三种非提取法虽可检测，但存在显著差异（详见表1）。改良的硅胶柱方案与标准方法无统计学差异（ANOVA检验）。

讨论

全球疫情期间，多种SC2快速检测方案被验证。巴拉圭团队测试的改良硅胶柱法采用易得耗材，其效率与商业试剂盒相当，但克服了样本质量差异、病毒运输介质干扰等非提取法的固有缺陷。该方案在极端病毒载量时效率略降，但为供应链紧张地区提供可行选择。

未引用文献提示

（巴拉圭卫生部健康监测总局2022年报告等未在正文引用）

基金声明

本研究获奥斯瓦尔多·克鲁兹基金会热带医学项目、南方共同市场结构融合基金（FOCEM COF 03/11）、巴西科技部（DECIT）等资助。

作者贡献声明

Gonzalez Sandra Beatriz：主导实验设计、数据分析和论文撰写；Ana Dias参与统计分析；Rodrigo Reis负责方法学验证；其他作者协助修订。

利益冲突声明

作者声明无影响研究的财务或个人关系。

致谢

感谢巴拉圭中央公共卫生实验室及Braulia Caetano博士提供的SC2毒株。

利益冲突补充声明

作者需披露可能影响研究或编辑决策的任何关系。