SNORD13H通过FBL依赖性2′-O-甲基化抑制肝细胞癌肿瘤进展的机制与临床意义

本文揭示了C/D框小核仁RNA（SNORD13H）在肝细胞癌（HCC）中的双重调控机制：通过纤维蛋白（FBL）依赖性2′-O-甲基化（Nm）修饰18S rRNA和RAS mRNA，抑制核糖体翻译效率并下调RAS蛋白表达，从而阻断MAPK/ERK信号通路激活。研究证实SNORD13H可作为HCC早期诊断的血浆标志物，其缺失通过表观遗传重编程促进肿瘤进展，为靶向RNA修饰的HCC治疗提供新策略。

　　

引言

肝细胞癌（HCC）作为高致死性消化系统肿瘤，其进展受表观遗传调控显著影响。近年研究发现，小核仁RNA（snoRNA）介导的RNA修饰（如2′-O-甲基化和假尿苷化）在肿瘤中发挥关键作用，但具体机制尚未阐明。本研究聚焦C/D框snoRNA成员SNORD13H，其在HCC组织中显著低表达，且与不良预后相关。

材料与方法

团队通过RNA测序筛选HCC差异表达snoRNA，结合CRISPR-Cas9基因编辑、异种移植模型及RTL-P（低dNTP浓度逆转录-PCR）技术，系统分析SNORD13H功能。实验采用Hep3B/MHCCLM3等HCC细胞系，通过SUnSET（翻译表面传感）检测核糖体活性，CLIP-seq验证FBL与靶RNA互作。

结果

SNORD13H抑制HCC恶性表型

SNORD13H敲除细胞增殖能力增强，克隆形成率提升2.1倍（p<0.01），裸鼠移植瘤体积增长3.5倍（p<0.001）。过表达则显著抑制肿瘤生长，证实其抑癌功能。

双重RNA修饰机制

1. 1.

   rRNA甲基化调控：SNORD13H缺失导致18S rRNA第1288位尿苷（Um1288）甲基化水平降低40%（p<0.001），促进核糖体成熟及全局翻译效率（puromycin标记蛋白量增加2.3倍）。

2. 2.

   RAS mRNA表观调控：FBL结合位点分析显示，SNORD13H通过反义序列引导KRAS/HRAS mRNA甲基化，敲除后RAS蛋白表达上调1.8倍（p<0.01），而mRNA水平反而下降，揭示转录后调控模式。

MAPK通路激活

RNA-seq与GSEA分析证实SNORD13H缺失特异性激活ERK1/2（磷酸化水平升高2.1倍），双敲除SNORD13H/RAS可逆转促癌效应。突变实验表明，SNORD13H第3片段（含FBL结合域）是抑制RAS的关键功能域。

讨论

本研究首次阐明SNORD13H通过"rRNA-mRNA双靶点甲基化"机制抑制HCC：

• •

  诊断价值：血浆SNORD13H水平可区分HCC患者（AUC=0.86），优于传统AFP标志物。

• •

  治疗潜力：靶向SNORD13H-FBL-RAS轴或可克服HCC异质性耐药。

局限性在于缺乏Nm-seq直接证据，且SNORD13H在啮齿类动物中缺失，需开发新型灵长类模型。未来研究可探索AAV载体递送SNORD13H的基因治疗潜力。