中国新型UL2基因缺失鸭肠炎病毒的致病机制与分子特征研究

《Virulence》：Pathogenic mechanisms and molecular features of a novel UL2 gene-deficient duck enteritis virus endemic to China

这篇研究首次报道了中国江苏地区流行的新型鸭肠炎病毒(DEV)JS2024分离株的全基因组特征。通过全基因组测序(WGS)和比较基因组分析，发现该毒株存在28个核苷酸突变（15个非同义突变）和首次在强毒株中发现的UL2基因528bp缺失。研究证实当前DEV疫苗(C-KCE株)对新型毒株保护率达95%，同时揭示了LORF11基因901bp区段可作为鉴别强弱毒株的分子标记。该成果为DEV的分子流行病学监测和疫苗研发提供了重要理论依据。

　　

【ABSTRACT】

鸭肠炎病毒(DEV)在中国江苏某鸭场爆发疫情中被鉴定为致病元凶。DEV-JS2024分离株表现出典型的高致病性特征：病鸭出现嗜睡、厌食、眼部分泌物等症状，肝脏、脾脏等器官广泛出血性病变。基因组分析揭示其GC含量45%，含76个开放阅读框(ORFs)，与强毒株CV和疫苗株C-KCE具有99.99%相似性。特别值得注意的是，该强毒株首次出现UL2基因528bp缺失，这对传统鉴别诊断方法提出了挑战。

【Introduction】

作为α疱疹病毒亚科成员，DEV（又称鸭瘟病毒）自1957年传入中国后已成为地方性流行病原。典型感染症状包括43°C以上高热、眼睑水肿等，死亡率可达100%。目前GenBank中仅收录少数DEV全基因组数据，包括中国强毒株CV、德国2085株等。2024年江苏某鸭场8周龄种鸭出现头颈肿胀、眼部分泌物等异常症状，经PCR确诊为DEV感染。

【Materials and methods】

研究采用MolPure? Viral DNA/RNA Kit提取样本核酸，使用2×Phanta UniFi Master Mix进行PCR检测。病毒分离采用SPF鸭胚接种法，经三代传代后收获尿囊液。全基因组测序由英潍捷基公司完成，使用MEGA 11.0构建系统发育树。动物实验选用20日龄SPF鸭，分别接种1000 MLD病毒或PBS对照，观察临床症状并采集组织进行病理学分析。

【Results】

临床特征显示感染鸭出现50%死亡率，剖检可见肝脏白色坏死灶、食管黏膜出血等典型病变。病毒分离株接种鸭胚后72-96小时内死亡，胚胎呈现全身性出血。实验感染证实DEV-JS2024可引起多器官出血性病变，组织病理学显示肝细胞肿胀坏死、脾脏白髓减少等特征。

基因组分析发现JS2024株含161,603bp，与CV株和C-KCE株相比存在28个核苷酸变异。特别值得注意的是：

1. 1.

   LORF11基因4341bp区域与CV株100%同源，其中901bp(nt1663-2564)可作为鉴别强弱毒株的可靠标记

2. 2.

   UL2基因出现528bp缺失（强毒株中首次报道），使其长度从1002bp缩减至474bp

3. 3.

   系统进化分析提示JS2024可能是疫苗株与强毒株的重组产物

流行病学调查显示，2024年采集的49份DEV阳性样本中，36份(73.5%)为新型JS2024样毒株，已在中国多省成为优势流行株。

【Discussion】

研究首次报道了强毒株中UL2基因的大片段缺失，这对基于UL2的PCR诊断方法提出挑战。GC含量45%的基因组结构可能影响病毒复制策略，而非同义突变集中在US7/US8（编码gI/gE）、UL47等与病毒包装传播相关的基因。虽然当前疫苗对新型毒株保护效果良好，但病毒潜在的基因组重组风险仍需警惕。

【Conclusion】

该研究系统阐明了新型DEV-JS2024株的分子特征和致病机制，揭示了UL2基因缺失对诊断方法的挑战，强调了持续基因组监测对鸭瘟防控的重要性。研究结果为DEV疫苗研发和分子流行病学研究提供了重要理论基础。