新墨西哥州发现新型淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒株（LCMV-ABQ）与免疫功能正常患者重症感染相关

本研究报道了新墨西哥州阿尔伯克基市一名免疫功能正常的35岁女性感染淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）后出现重症的罕见病例。通过对其住所捕获的20只家鼠（Mus musculus）进行检测，发现85%个体携带LCMV RNA，并首次完成该地区LCMV-ABQ毒株全基因组测序（GenBank PX021332-PX021333）。系统发育分析显示该毒株属于I系，S/L片段与已知毒株最高同源性仅87.28%/82.03%，GP1蛋白携带F260L突变可能增强宿主受体结合能力。该研究揭示了LCMV在北美西南部的独特遗传特征及潜在公共卫生风险。

　　

ABSTRACT

淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）作为沙粒病毒科原型病原体，近期被列为NIAID优先研究病原体。2023年新墨西哥州阿尔伯克基市一名免疫功能正常的35岁女性出现严重神经系统症状，血清学检测确诊LCMV感染。该病例的特殊性在于LCMV通常仅在免疫缺陷个体引发重症。

Rodent sampling and LCMV detection

流行病学调查显示患者住所存在严重鼠害，研究人员通过Sherman活陷阱捕获20只家鼠（Mus musculus domesticus亚种），肝脏组织PCR检测显示17/20携带LCMV RNA，ELISA检测发现3/20存在抗NP蛋白IgG抗体。值得注意的是，胚胎组织中也检出病毒RNA，证实垂直传播可能。对比新墨西哥州其他4个地点捕获的69只家鼠均为阴性，表明该住所形成局部病毒热点。

Sequencing the LCMV genome

从编号AQS11的鼠肝样本中成功获得LCMV-ABQ毒株全基因组序列。S片段（3.4 kb）和L片段（7.2 kb）编码区分析显示：GP1蛋白携带F260L突变（增强α-DG受体结合），L聚合酶保留Armstrong毒株特征（K1076未突变），NP蛋白保守DIEGR基序（D382-G385-R386）维持干扰素拮抗功能。特别发现S片段1559-1619核苷酸缺失的缺陷病毒颗粒，这类截短基因组可能参与病毒复制调控。

Phylogenetic analysis

系统发育树构建显示LCMV-ABQ属于I系，与人类感染相关的811316（美国移植病例株）和Traub（1935年经典株）亲缘最近。S片段与JN687949.1株同源性87.28%，L片段与DQ868488.1株同源性82.03%。氨基酸比对显示：GP与Traub株相似度97.36%，NP达97.31%，但L聚合酶进化差异最大（与Traub株仅89.59%相似）。

Discussion

该研究首次揭示：

1. 1.

   北美西南部存在独特的LCMV-ABQ谱系，其S/L片段重组模式不同于已知毒株

2. 2.

   病毒热点形成与家鼠种群密度正相关（91%陷阱捕获率对应85%感染率）

3. 3.

   GP1-F260L突变可能通过增强α-DG结合促进免疫逃逸，但缺乏L-K1076Q突变提示复制能力受限

4. 4.

   垂直传播证据（胚胎感染）与慢性感染特征（高病毒载量/低抗体应答）并存

研究局限性包括未能获得患者病毒分离株，且全州范围监测样本量有限。建议加强西南部啮齿动物LCMV监测，并将该病原体纳入不明原因脑膜炎的常规鉴别诊断。