综述：乳腺癌诊断和治疗管理中DNA甲基化生物标志物的研究现状

这篇综述系统阐述了DNA甲基化（DNA methylation）作为乳腺癌早期诊断、分型、治疗预测和预后评估生物标志物的研究进展。文章重点探讨了CpG岛（CpG islands）异常甲基化在ER+/HER2-和TNBC（三阴性乳腺癌）中的临床应用价值，特别介绍了PITX2甲基化检测试剂盒（Therascreen PITX2 RGQ PCR kit）等转化成果，并展望了循环肿瘤DNA（ctDNA）液体活检技术的发展前景。

　　

DNA甲基化与乳腺癌的分子特征

DNA甲基化是最早被发现且研究最深入的表观遗传修饰，指在胞嘧啶第5位碳原子上添加甲基基团形成5-甲基胞嘧啶（5mC）。在哺乳动物中，DNA甲基化主要发生在CpG二核苷酸位点，人类基因组约含2800万个CpG位点。DNMT（DNA甲基转移酶）家族催化这一过程，其中DNMT1负责维持甲基化模式，DNMT3A/B介导de novo甲基化。癌症细胞表现出独特的甲基化特征：基因组广泛低甲基化伴随CpG岛启动子高甲基化，这种"甲基化重编程"现已被列为癌症的重要标志之一。

乳腺癌的表观遗传景观

作为全球女性最常见的恶性肿瘤，乳腺癌具有高度异质性。根据激素受体状态可分为ER+（雌激素受体阳性）、PR+（孕激素受体阳性）、HER2+（人表皮生长因子受体2阳性）和三阴性乳腺癌（TNBC）。早期研究发现BRCA1和ESR1基因启动子异常甲基化与乳腺癌发生相关。全基因组分析揭示不同分子分型具有独特的甲基化特征，例如TNBC存在282个特异性甲基化探针，对应36个基因组区域。

诊断与分型生物标志物

在诊断领域，Downs团队开发的10基因甲基化检测panel可在5小时内区分乳腺肿瘤与良性组织，灵敏度达96%。对于临床分型，研究发现ESR1、FOXA1和GATA3结合区域的甲基化具有亚型特异性。罕见的叶状肿瘤也被证实具有53个差异甲基化区域（DMRs），可区分良恶性病变。

治疗预测标志物

化疗预测方面，PITX2启动子高甲基化在ER+/HER2-患者中预示化疗反应差，但在TNBC中却与良好反应相关，这种"甲基化悖论"凸显了分子分型的重要性。内分泌治疗领域，ESR1启动子甲基化能预测他莫昔芬疗效，其预测效能甚至优于IHC检测的激素受体状态。新兴的免疫治疗中，LINE-1元件低甲基化与PD-1抑制剂疗效相关。

预后评估新策略

肿瘤微环境（TME）的甲基化特征为预后评估提供了新思路。Jeschke团队开发的MeTIL特征包含PTPRCAP等5个CpG位点，可量化肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）。在TNBC中，低甲基化cluster患者预后显著优于高甲基化组。Zhang等建立的10-CpG表观遗传风险评分与TME炎症状态负相关。

液体活检技术突破

循环肿瘤DNA（ctDNA）检测开创了无创监测新纪元。mDETECT检测针对47个甲基化区域，在转移性TNBC中灵敏度达76%。cMethDNA检测的10基因panel（含RASSF1等）已转化为自动化LBx-BCM检测卡盒，可在治疗4周时预测生存结局。Galleri^TM多癌种早检技术则展示了甲基化标志物的广谱应用潜力。

未来发展方向

当前挑战包括早期患者ctDNA浓度低、检测标准化等问题。随着ddPCR等低成本检测技术的普及，以及TME研究的深入，甲基化标志物有望在精准分型、动态监测和个体化治疗等领域实现更大突破。特别值得关注的是将人工智能与多组学数据整合，开发新一代智能诊断系统。