
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
综述:机器学习驱动的培养条件和培养基成分优化以减轻单克隆抗体生产中的电荷异质性:当前进展与未来展望
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月22日 来源:mAbs 7.3
编辑推荐:
这篇综述系统阐述了机器学习(ML)优化单抗(mAb)生产工艺的最新策略,重点介绍了通过算法调控培养参数(如pH、温度)和培养基组分(如缓冲盐、糖类)来降低电荷变异体(如酸性/碱性峰)的前沿技术,结合噬菌体展示(phage display)和SpyTag/SpyCatcher蛋白连接技术,为开发高亲和力(KD<10 nM)、高稳定性(Tm>72°C)的治疗性抗体提供了创新方案。
Pioneer抗体库作为迄今最大规模合成人源Fab抗体库之一,通过SpyDisplay噬菌体展示系统实现了2.2×1011功能性抗体的高效筛选。该技术利用SpyTag-SpyCatcher共价连接体系,将抗体片段与噬菌体pIII蛋白快速偶联,其独特设计包含两步β-内酰胺酶(bla)筛选步骤,确保90%以上克隆具有正确开放阅读框。文库采用IGHV1-69/IGHV3-23重链和IGKV1-39/IGLV3-1轻链种系基因,通过三核苷酸合成技术(trinucleotide synthesis)精准控制CDR区多样性,显著降低了天冬酰胺脱酰胺(Asn deamidation)等翻译后修饰风险。
针对免疫检查点TIGIT的筛选战役中,从文库直接获得112种独特抗体,其中55种经BLI验证具有亚纳摩尔级亲和力(KD=0.3-9.8 nM)。在模拟肿瘤微环境的细胞实验中,抗体AbD54577阻断TIGIT/CD155相互作用的EC50达0.8 μg/mL,优于临床阶段参照药vibostolimab。类似地,针对IL-6RA的筛选获得144种抗体,27%具有<1 nM亲和力,其中AbD57881在抑制IL-6信号传导的iLite实验中IC50为0.15 nM,媲美已上市药物tocilizumab。
针对GPCR家族成员C5aR和CXCR4的筛选尤为引人注目。使用Salipro纳米颗粒展示技术,成功获得48种抗CXCR4抗体,其中16种为亚纳摩尔级。在Transwell迁移实验中,抗体将Jurkat细胞趋化作用抑制至对照组的10-40%。而抗C5aR抗体AbD61531在iLite检测中IC50低至0.04 nM,较参照药avdoralimab活性提升8倍。这些成果打破了GPCR难以产生功能性抗体的传统认知。
文库抗体展现卓越的理化特性:SEC检测显示>95%单体率,HIC保留时间<5分钟提示低疏水性,加速稳定性试验(37°C/4周)未出现聚集。模块化组装技术可将SpyTag标记的Fab快速转化为HRP偶联物或双特异性抗体,如在TIM-3检测中,29种抗体全部在流式细胞术和免疫荧光中显示特异性信号。这种"即用型"特性将传统抗体开发周期缩短至10周以内。
尽管Pioneer文库在电荷异质性控制方面表现优异(序列 liabilities 发生率比天然抗体低30%),但针对CXCR4等靶点仍存在部分多反应性抗体。下一步将整合深度学习模型,在CDR设计阶段进一步优化电荷分布。结合微流控单细胞筛选技术,有望将文库功能性提升至1012量级,为个性化肿瘤免疫治疗提供更强大的武器库。
生物通微信公众号
知名企业招聘