苹果砧木M9根系微生物组抗根腐病的宏基因组学解析及其生物防治潜力

为解决苹果砧木根腐病抗性机制不明的问题，研究人员通过Illumina平台宏基因组扩增子测序(m-NGS)对比分析了耐受型M9与易感型MM106根际微生物组。研究发现M9根系富集了Paraburkholderia、Paenibacillus等具有生防潜力的菌属（941种vs MM106的559种），为开发靶向生物制剂及抗病育种提供了关键微生物资源。

　　

苹果栽培中，马尔金9号(M9)和马尔金默顿106号(MM106)砧木因其矮化特性备受青睐，但根腐病正成为苗圃和果园的重大威胁。有趣的是，缺乏已知抗病基因的M9砧木却展现出对病原菌的耐受性。

研究团队运用宏基因组扩增子测序技术(metagenomic amplicon-based sequencing)，在Illumina平台上对两种砧木根际样本进行深度解析。测序获得25-29百万条读长，鉴定出M9根系携带941种细菌，显著多于MM106的559种。两组共有的Rhodanobacter、Burkholderia等菌属在M9中丰度更高，而具有生防潜力的明星菌群——包括Paraburkholderia、Paenibacillus和Bacillus等——竟为M9根系所独有。

这些发现不仅揭示了M9砧木耐受根腐病的微生物组特征，更开辟了通过分离功能菌株开发生物制剂的新思路。未来研究可通过功能宏基因组学和转录组学，深入解析微生物抑制病原的分子机制，为苹果抗病育种和生态栽培提供微生物资源宝库。