非经典激活机制:分子动力学模拟揭示食欲素受体OX2与lemborexant介导的G蛋白活化新机制

【字体: 时间:2025年08月23日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究通过微秒级分子动力学模拟,首次揭示了失眠治疗药物lemborexant作为食欲素受体OX2非典型激动剂的分子机制。研究人员构建了OX2-Gq蛋白复合体模型,发现lemborexant能诱导类似经典激动剂compound 1的受体构象变化,并通过调控Gα亚基开关促进GDP/GTP交换,为理解GPCR非经典信号转导提供了新视角。该发现不仅解释了lemborexant在癌症细胞中促凋亡的"类激动剂"效应,更为靶向G蛋白偶联受体的药物设计开辟了新思路。

  

在神经科学和药物研发领域,食欲素系统一直被视为调控睡眠/觉醒周期的"生物开关"。1998年发现的食欲素神经肽(Orexin-A/OxA和Orexin-B/OxB)通过两种G蛋白偶联受体(OX1和OX2)发挥作用,已成为失眠治疗的重要靶点。然而近年来研究发现,这类受体在癌症中扮演着令人意外的双重角色——既能通过经典Gq通路调控钙离子释放,又能通过非经典通路诱导肿瘤细胞凋亡。

传统认知中,lemborexant作为双OX1/OX2受体拮抗剂被批准用于失眠治疗。但法国巴黎西岱大学和波兰华沙大学联合团队的最新实验发现,该药物在癌细胞模型中表现出促凋亡的"类激动剂"特性。这一反常现象向科学家们抛出了关键问题:一个结构明确的拮抗剂为何能激活受体?其分子机制是否与经典激动剂存在本质差异?

为解答这些疑问,Paulina Dragan和Dorota Latek领衔的研究团队在《Scientific Reports》发表了突破性成果。研究人员采用GPU加速的全原子分子动力学(MD)模拟技术,以2微秒的超长时间尺度追踪了OX2受体与全长度Gq蛋白的相互作用动态。研究特别比较了经典激动剂compound 1与lemborexant对受体激活的影响,通过构建同源模型、膜环境模拟和构象分析等技术手段,首次在原子层面捕捉到非经典激活的关键事件。

关键方法

研究团队以7L1V(OX2-mini-Gsqi复合体)为模板,通过Modeller v.10.4构建包含全长度Gαq的活性态模型。使用CHARMM-GUI Membrane Builder创建含POPC/胆固醇(3:1)的膜环境,经NAMD 3.0 Alpha进行2微秒分子动力学模拟。通过分析DRW、PVF等微观开关构象变化,结合Gα亚基的宏观构象转变,系统追踪了GDP释放的分子路径。

Similarities in binding modes between the classic OX2 agonist compound 1 and lemborexant

研究发现lemborexant在活性态OX2中的结合模式异常稳定,其RMSD波动与经典激动剂compound 1相当。特别值得注意的是,ECL2(第二胞外环)的闭合使Q3.32残基向受体内部移动,这种构象变化在肽类激动剂中从未观察到,提示小分子配体可能具有独特的激活机制。

2 agonist compound 1 and lemborexant.'>

Activation-like changes of microswitches in Gα

研究首次发现F341G.H5.08和D277G.HG.02两个微观开关的构象变化:在lemborexant系统中,F341G.H5.08通过逆时针旋转转变为"开启"状态,而D277G.HG.02与GDP鸟嘌呤环的相互作用断裂。这些变化与经典G蛋白激活途径中观察到的特征高度一致。

Activation-like changes of macroswitches in Gα inducing the GDP/GTP exchange

全局构象分析显示,lemborexant诱导的Gα开放程度显著高于compound 1。特别在switch III区域,lemborexant系统的RMSD波动更大,促使螺旋HD和HA发生类似6CMO(视紫红质-Gi复合体)的向下移动,形成GDP/GTP交换隧道。

α macroswitches inducing the opening of the GDP/GTP exchange tunnel upon compound 1 binding to OX2.'>

Global conformational changes in Gα

研究提出全新的G蛋白激活序列模型:F341G.H5.08构象变化触发switch I区域R183G.hfs2.02位移,进而破坏其与E49G.slh1.04的盐桥;随后switch III的E241G.s4h3.10释放并与R183形成临时相互作用,最终导致AHD(α螺旋结构域)的协同开放。

这项研究不仅解释了lemborexant在癌细胞中表现出的"偏倚激动"现象,更揭示了GPCR非经典激活的普适机制。在理论层面,研究建立的G蛋白激活序列模型为理解Gq偶联受体信号转导提供了新范式;在应用层面,发现小分子拮抗剂的"类激动剂"特性为开发靶向凋亡通路的抗癌药物开辟了新途径。正如作者强调的,这项成果将促使科学界重新审视GPCR配体的功能分类标准,对神经精神疾病和癌症的精准治疗具有重要指导意义。

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