多民族队列中SARS-CoV-2感染的miRNA生物标志物：预后与治疗监测新策略

本研究针对COVID-19诊断和预后生物标志物缺乏的问题，通过miRNA测序和qRT-PCR技术，在多民族队列中鉴定出14种差异表达miRNA和4种新型miRNA，其中miR-146b-3p等7种miRNA与临床参数联合诊断准确率高达AUC=0.982。该研究为无创监测和未来抗病毒策略开发提供了重要分子靶点。

　　

在全球COVID-19大流行的背景下，SARS-CoV-2感染导致的临床表现存在显著异质性，从无症状到多器官衰竭不等。尽管核酸检测仍是诊断金标准，但缺乏能够预测疾病进展和预后的可靠生物标志物。更棘手的是，不同种族、性别和基础疾病患者的免疫应答差异，使得单一生物标志物的开发面临巨大挑战。

正是在这样的背景下，Farah Mustafa和Waqar Ahmad等研究者将目光投向了microRNA（miRNA）——这类长约22个核苷酸的非编码RNA分子，因其组织特异性表达和在体液中的稳定性，已成为疾病诊断的新宠。特别值得注意的是，虽然血液miRNA研究较多，但作为SARS-CoV-2主要感染部位的呼吸道样本miRNA谱却鲜有报道。

这项发表在《Scientific Reports》的研究创新性地采用鼻咽拭子样本，通过miRNA测序（miRNAseq）和定量逆转录PCR（qRT-PCR）技术，对阿联酋多民族人群（涵盖40个国家）的SARS-CoV-2感染相关miRNA特征进行了系统分析。研究人员收集了154例患者和31例对照的临床样本，最终对51例样本（38例感染/13例对照）进行深度测序，发现：

关键技术方法包括：1）多中心样本采集（来自Rashid医院和UAE大学）；2）Macherey-Nagel NucleoSpin miRNA提取技术；3）BGI的DNBSEQ平台进行UMI小RNA测序（20M reads）；4）Dr. Tom生物信息学分析流程；5）TaqMan Advanced miRNA Assays验证。

患者临床特征

研究发现感染者血清铁蛋白（1060 vs 120 ng/mL）、CRP（79.5 vs 10.9 mg/L）显著升高，而肾小球滤过率（GFR）下降（97.6 vs 120.5 mL/min），这些变化与miRNA表达谱显著相关。

miRNA表达谱特征

通过测序共检测到1788个miRNA，其中492个为感染者特有。差异表达分析鉴定出48个显著改变的miRNA（p/Q<0.05），包括：

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  14个高变化miRNA（|FC|≥2）：如miR-146b-3p（上调5.7倍）和miR-202-5p（下调10.4倍）

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  4个新型miRNA：如novel-miR-264-5p（AUC=0.902）

诊断效能验证

ROC分析显示：

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  单一最佳标志物：miR-146b-3p（AUC=0.999）

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  组合标志物：6种miRNA联合AUC达0.972

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  与临床参数联用：AUC提升至0.982

机制探索

通过STRING数据库分析发现，miRNA靶基因显著富集于：

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  FoxO、MAPK和PI3K-AKT等信号通路

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  炎症反应、细胞凋亡等生物学过程

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  乳腺癌、肺癌等多种疾病关联

讨论部分指出，该研究首次系统描绘了鼻咽部miRNA在SARS-CoV-2感染中的变化图谱，其中miR-146b-3p可能通过调控IL-6等促炎因子影响疾病进程，而miR-30c-5p与肾功能指标的相关性为器官损伤监测提供了新思路。值得注意的是，部分miRNA（如miR-125b-5p）在不同体液样本中表达趋势一致，提示其作为跨平台生物标志物的潜力。

这项研究的创新性在于：1）采用临床常规采集的鼻咽拭子样本，便于转化应用；2）涵盖多民族人群，增强结果普适性；3）发现的新型miRNA为药物开发提供了全新靶点。作者建议未来研究应扩大样本量，并探索这些miRNA在调节病毒复制中的直接作用，为应对未来可能出现的新变异株储备科学武器。