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全外显子组测序揭示跨性别个体易感基因位点:雌激素受体介导的神经发育通路新发现
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月23日 来源:Sexual Medicine 2
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本研究针对跨性别群体性别认同焦虑的遗传基础,通过高深度全外显子组测序(WES)技术,对23例患者进行罕见变异筛查。研究人员发现19个雌激素受体(ER)信号通路相关基因存在479个罕见致病性变异,涉及轴突导向和突触组装等神经发育过程。该成果为理解性别二态性脑发育的遗传架构提供了新视角,发表于《Sexual Medicine》杂志。
性别认同是人类最复杂的生物学特征之一,但长期以来其遗传基础如同"黑箱"。尽管社会已逐渐接受性别多样性,科学界对跨性别者大脑发育的分子机制仍知之甚少。传统观点认为性别认同主要受心理和社会因素影响,然而临床观察发现:74.6%的跨性别青少年伴有抑郁症状,82.4%产生过自杀念头,这些惊人的数据暗示着潜在的生物学因素。动物研究表明,雌激素受体(ER)介导的信号通路在脑性别分化中起关键作用——睾酮通过芳香化酶转化为雌二醇,激活特定脑区如腹内侧下丘脑(VMN)和内侧视前区(mPOA)的神经元重塑。那么,人类性别认同是否也存在类似的遗传密码?
为解开这个谜题,上海精神卫生中心联合多家机构开展了开创性研究。团队采用全外显子组测序(WES)技术,对23例跨性别者(13例出生指定男性/AMAB,10例出生指定女性/AFAB)进行基因组分析。通过Illumina NovaSeq 6000平台实现平均75×测序深度,结合BWA-MEM比对和GATK变异检测,最终锁定1741个罕见变异(MAF<1%)。创新性地采用KEGG/GO富集分析,发现这些变异显著富集于轴突导向和神经元投射等通路。
主要结果
变异特征分析:在266,265个高质量变异中,发现48,508(22.3%)非同义突变,包括225个错义、27个无义、43个移码突变。图2显示外显子区变异占26.26%,其中移码插入缺失突变占比达13.77-19.40%。

关键基因发现:19个ER通路基因携带罕见有害变异,包括调控NMDA受体的SHANK3、参与铜离子转运的X染色体基因ATP7A等。表4显示CNOT2作为ER信号负调控因子,其移码突变在15例患者中出现。
性别差异线索:Y染色体基因CD24在4例患者中出现纯合突变,该基因与睾丸损伤相关;X连锁基因ATP7A的错义突变可能影响神经元迁移。
讨论与意义
这项研究首次系统描绘了跨性别群体的遗传图谱,其突破性体现在三方面:
技术创新:建立WES结合多组学分析流程,克服了传统GWAS对罕见变异检测的局限。
理论突破:验证"多基因阈值模型",即累积的ER通路变异可能改变脑性别分化轨迹。
临床转化:为开发基于遗传标志物的个性化干预提供靶点,如SHANK3调控剂可能缓解性别焦虑。
值得注意的是,研究者特别强调:这些发现不应被误解为将跨性别身份"病理化"。正如ICD-11将"性别焦虑"重新归类为"性别不一致",科学探索的目的是理解多样性而非定义正常。未来需扩大样本验证这些候选基因,并开展类器官模型等功能实验。这项发表于《Sexual Medicine》的研究,为解开性别认同的生物学之谜打开了新的大门。
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