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多尺度模拟揭示RAS-RAF复合体动态特性与脂膜耦合机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月24日 来源:Biophysical Journal 3.1
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来自国际团队的研究人员通过多尺度模拟(MuMMI框架)结合实验方法,探究了RAS-RAF信号通路的启动机制。研究发现,膜脂环境对RAS-RBDCRD复合体的构象状态具有特异性调控作用,其形成的脂质"指纹"范围远超单独KRAS4b蛋白。该研究为理解信号转导中蛋白-膜互作提供了新视角。
这项突破性研究通过革命性的多尺度模拟技术(包括MuMMI框架的机器学习耦合和全原子尺度扩展),首次系统揭示了RAS-RBDCRD复合体在膜表面的动态行为。研究团队完成了35,000次粗粒度和10,000次全原子分子动力学模拟,发现复合体会在膜上形成独特的构象状态,每种状态对应特异的脂质排布模式——这些脂质"指纹"的影响范围远超单独的KRAS4b蛋白。有趣的是,虽然RAS-RBDCRD复合体表现出强相互作用,但并未发现显著的蛋白-蛋白取向偏好性。这些发现暗示:特定的膜微环境可能通过空间共定位机制,显著提升信号复合体形成的概率,为理解RAS-RAF信号级联的启动提供了全新分子视角。
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