染色质动态特性揭示其三维折叠机制的关键原理

【字体: 时间:2025年08月24日 来源:Biophysical Journal 3.1

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  【编辑推荐】来自国际团队的研究人员通过构建活性环挤出(loop extrusion)与染色质内相互作用模型,首次阐明二者在染色质时空组织中的分工:动态特性由环挤出主导,而静态接触图谱(contact map)则由染色质内相互作用决定。该研究突破传统分形球(fractal-globule)模型局限,提出必须同步检测结构与动态参数才能准确解析染色质组织机制。

  

染色质的动态特性为理解其折叠原理提供了关键线索。尽管三维静态结构已被广泛研究,但染色质作为动态结构,其随时间变化的特性对生物功能至关重要。现有研究虽已确认染色质内相互作用和环挤出机制(loop extrusion)对染色质组织的重要性,但二者在时空组织中的具体分工仍不明确。

通过模拟活性环挤出与染色质内相互作用的耦合模型,研究发现:在特定条件下,可测量的动态参数完全由环挤出机制主导,而群体平均接触图谱(population-averaged contact map)却可能仅反映染色质内相互作用——此时环挤出几乎不参与结构塑造。值得注意的是,环挤出作用下的动态标度指数(dynamic scaling exponents)与实验观测高度吻合,这与现有染色质分形球模型(fractal-globule)的预测存在显著差异。该研究强调,唯有同步解析结构与动态参数,才能准确破译染色质的组织密码。

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