单细胞组学驱动的肿瘤治疗靶点组合数据库TargetPair:临床转化与精准医学的新桥梁

【字体: 时间:2025年08月25日 来源:Journal of Molecular Biology 4.5

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  本文推荐:研究者通过系统整合3470项临床试验和1396篇文献,构建了首个专注于肿瘤治疗靶点组合(TPs)的单细胞组学数据库TargetPair,涵盖60个获批、1580个临床阶段及7424个实验阶段靶点对,并基于55个scRNA-seq数据集(302万细胞/16癌种)解析了共表达网络、细胞分布等特征。该资源为破解肿瘤微环境(TME)复杂性、理性设计多靶点疗法(如双抗/联合用药)提供了全新工具。

Highlight

靶向治疗虽革新了癌症治疗格局,但耐药性和肿瘤复发仍是临床痛点。协同靶向肿瘤细胞内在靶点(CITs)与微环境外在靶点(CETs)的策略展现出显著优势——当前临床研究中,超60%试验聚焦多靶点方案(如双特异性抗体或联合用药)。然而,现有数据库(如TTD11/DrugBank12)仅收录少量经临床验证的多靶点药物,且缺乏靶点对的系统解析。TargetPair应运而生,填补了这一关键空白。

Statistics of TargetPair Database

数据库核心资产包括:①87个获批多靶点药物(源自FDA标签/NCI药物词典);②2308个临床阶段组合(来自3470项试验);③3428个临床前组合(经文献验证)。所有靶点均通过TTD/DrugBank等权威数据库交叉验证,确保数据可靠性。

Data Collection

数据采集采用多维度策略:从ClinicalTrials.gov29提取试验方案,结合ChEMBL30和IUPHAR药理学指南31进行靶点注释。单细胞数据经严格质控,覆盖13类细胞/16种癌症,构建了迄今最全面的肿瘤靶点互作图谱。

Conclusions

TargetPair通过整合临床前-临床全周期数据,首次实现了从“经验性组合”到“单细胞组学驱动”的范式转变。其特色功能包括:靶点共表达热图、细胞亚群特异性评分、通路富集网络等,为研究者提供了“临床相关性+机制可解释性”的双重保障。

(注:翻译中省略文献标识[1]等,保留专业术语缩写格式,如scRNA-seq/TME等)

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