根际土壤中新链霉菌DZ1-3的基因组解析及其强效抗真菌化合物的研究

本研究从榴莲、酸橙和红树根际土壤中分离出15株放线菌，其中链霉菌DZ1-3对尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）等6种植物病原真菌表现出广谱抑制活性。通过基因组分析（antiSMASH）鉴定出27个次级代谢产物生物合成基因簇（BGCs），并检测到二十烷（eicosane）等关键抗真菌化合物，为开发微生物生物防治剂提供了新候选。

　　

Highlight

本研究亮点在于从极端环境根际土壤中分离的链霉菌DZ1-3，其表现出对多种植物病原真菌（如尖孢镰刀菌SA04）的强效抑制能力。通过全基因组分析揭示了27个生物合成基因簇（BGCs），其中包含与已知抗真菌剂相关的通路，凸显了该菌株在农业生物防治中的应用潜力。

Isolation and characterization of strains

从榴莲、酸橙和红树根际土壤中分离的15株放线菌中，12株为链霉菌属（Streptomyces），3株为小单孢菌属（Micromonospora）。通过16S rRNA基因测序和表型特征鉴定，菌株DZ1-3与Streptomyces pravulus的ANIb相似度达98.88%，DNA-DNA杂交结果为93%，确认为新菌株。

Conclusion

菌株DZ1-3的乙醚粗提物中检出二十烷（eicosane）、十六烷（hexadecane）等抗真菌化合物，其基因组中预测的BGCs为开发新型生物农药提供了分子基础，尤其对镰刀菌病害防治具有重要价值。