从稻壳中鉴定潜在的结直肠癌c-myc抑制剂：一种分析计算方法

《ChemistrySelect》：Identification of Potential c-myc Inhibitors for Colorectal Cancer from Rice Husk: An Analytical and Computational Approach

本研究通过GC-MS、FTIR及UV-Vis从稻壳中筛选出17种化合物，发现actinobolin和9,12,15-十八三烯酸甲酯对c-Myc蛋白抑制活性最强（?7.6和?7.1 kcal/mol），分子动力学模拟证实其结构稳定性，ADMET分析显示其药物成性，为结直肠癌治疗提供新方向，但需进一步体外及体内实验验证。

　　

图形摘要

利用GC-MS、FTIR和UV-Vis技术对稻壳中的植物化学物质进行了筛选，以识别潜在的结直肠癌c-Myc抑制剂。通过分子对接和动力学模拟，发现actinobolin和9,12,15-十八三烯酸甲酯具有很强的结合亲和力和稳定性。ADMET分析表明它们具有药物特性，提示在进一步的体外和体内验证后具有良好的治疗潜力。

摘要

结直肠癌是一种全球范围内常见的癌症，导致数百万人死亡。该疾病有多种基于DNA、RNA和/或蛋白质的分子生物标志物，这些生物标志物可以被多种植物化学物质抑制。稻壳（Oryza sativa L.）中的许多化合物由于能够抑制这些生物标志物，因此可以作为抗癌的化学预防剂。在本研究中，我们利用GC-MS、FTIR和UV–vis光谱技术从稻壳的甲醇和正己烷提取物中鉴定了17种具有抑制结直肠癌生物标志物潜力的化合物。在各种结直肠癌标志物中，包括COX-2、MMPs和β-连环蛋白，c-Myc是一种众所周知的致癌基因。尽管经过四十多年的研究，至今尚未有c-Myc抑制剂获得临床应用批准。因此，我们通过分子对接技术分析了c-Myc蛋白（PBD ID：6M75）与这些植物化学物质的相互作用。研究发现，actinobolin（C1）和9,12,15-十八三烯酸甲酯（C2）与c-Myc蛋白的结合亲和力较高，分别为?7.6和?7.1 kcal/mol。通过100 ns的分子动力学模拟确定了对接复合物的稳定性和刚性。与Apo蛋白相比，这两种候选复合物在RMSD、Rg、SASA、RMSF和氢键分析中均表现出稳定性，仅有轻微波动。MMPBSA结合自由能分析表明C2复合物比C1更稳定，而叠加图显示两种复合物在模拟过程中保持了其结构稳定性，未发生构象变化。根据ADMET和其他常用于药物设计的研究方法，所有候选化合物都具有药理活性，其中actinobolin和9,12,15-十八三烯酸甲酯被确定为结直肠癌治疗的有希望的靶点。然而，必须通过全面的体外和体内实验进一步探索这些化合物的疗效。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。