DNA可弯曲性调控先锋转录因子与核小体的结合机制研究

来自国际团队的研究人员通过开发PIONEAR-seq高通量生化检测技术，系统分析了11种人类先锋转录因子(TFs)在Widom 601序列与基因组序列核小体上的结合特征。研究发现先锋因子结合虽由识别基序主导，但受核小体DNA序列背景调控，特别是DNA局部可弯曲性成为真核基因组cis调控的新层次。

　　

细胞命运的决定关键在于一类特殊的"先锋"转录因子（pioneer transcription factors），这些具有序列特异性的蛋白能够直接结合核小体上的识别基序。有趣的是，这些因子在基因组中仅占据少量潜在结合位点，暗示存在更深层的调控机制。

研究团队为此开发了突破性的PIONEAR-seq技术，通过对11种人类转录因子在人工序列(Widom 601)和天然基因组序列核小体上的结合进行高通量分析，揭示了DNA序列背景的重要调控作用。特别值得注意的是，某些在人工序列上表现为周期性结合的转录因子，在基因组序列核小体上却呈现末端结合特征。

这项研究提出了创新性的调控模型：核小体DNA的局部可弯曲性（bendability）就像分子尺规，精确调控着先锋转录因子的结合位置。这一发现为理解真核基因组复杂的^cis调控网络增添了新的理论维度，相关技术PIONEAR-seq也为表观遗传学研究提供了强有力的工具。