马里巴马科城市小型哺乳动物中的人畜共患病微生物：本土与外来入侵物种的比较研究

本研究针对马里巴马科城市环境中本土与外来入侵小型哺乳动物携带的人畜共患病微生物（如Bartonella spp.、Coxiella burnetii和Trypanosoma otospermophili）展开调查，通过分子检测技术（qPCR/PCR）首次在马里发现C. burnetii MST12基因型及新型Bartonella基因型，揭示了城市啮齿类动物作为人畜共患病潜在储存库的公共卫生风险，为西非地区人兽共患病监测提供关键数据。

　　

在全球人畜共患病疫情持续上升的背景下，啮齿类动物作为40%哺乳动物物种的代表，已成为多种病原体的"移动储存库"。西非地区虽已发现拉沙热病毒等典型 rodent-borne 病原体，但马里作为内陆国家，其城市生态系统中微生物的传播动态长期缺乏系统研究。尤其值得关注的是，随着城市化进程加速，外来入侵鼠种（如褐家鼠Rattus norvegicus）与本土物种的生态位重叠可能加剧病原体跨物种传播风险。

为填补这一空白，由Charles Kumakamba领衔的国际研究团队在《Scientific Reports》发表论文，对马里首都巴马科捕获的371只小型哺乳动物（含6物种）脾脏样本展开系统性筛查。研究采用多重分子检测技术（qPCR结合常规PCR），针对7类病原体（Bartonella spp.、Coxiella burnetii、Borrelia spp.等）进行靶向基因分析，并通过测序和系统发育分析鉴定病原体基因型。样本来源于2021-2022年间巴马科6个行政区的12个代表性社区，涵盖城市生态梯度。

主要研究结果

Small mammal sampling

定量分析显示外来入侵鼠种（家鼠Mus musculus和Rattus属）占样本总量的75%，其中M. musculus占比最高（51.8%）。这种物种构成反映了城市化对小型哺乳动物群落的重塑效应。

Molecular detection of microorganisms

在2.96%（11/371）的样本中检出三类病原体：

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  Bartonella spp.检出率2.43%（9/371），在褐家鼠（9.09%）和非洲巨鼠Cricetomys gambianus（66.67%）中呈现高携带率。通过rpoB基因测序鉴定出3个新型B. elizabethae基因型（与人类感染性心内膜炎相关）和2个B. mastomydis新基因型。

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  Coxiella burnetii在黑家鼠R. rattus中检出MST12基因型（0.27%），该基因型此前仅在阿尔及利亚乳制品和欧洲人类临床样本中发现，首次在啮齿类中报道。

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  首次在马里褐家鼠中发现Trypanosoma otospermophili（0.27%），与加蓬报道的病原体同源。

Sequencing and phylogenetic analysis

系统发育树显示，B. elizabethae新基因型与亚洲、美洲菌株具有高度相似性，印证了伴随鼠类全球入侵的病原体扩散模式。C. burnetii MST12的检出提示城市啮齿类可能参与Q热传播链。

讨论与意义

该研究揭示了三个关键发现：首先，入侵鼠种在巴马科城市生态系统中占据主导地位，但其微生物携带率（2.96%）显著低于欧洲本土鼠类报道值（如德国78.2%），可能反映"入侵悖论"——物种入侵过程中病原体丢失与本地微生物定植滞后的综合效应。其次，检出人类致病性C. burnetii MST12基因型具有重要公共卫生意义，提示需要建立城市Q热监测体系。最后，新型Bartonella基因型的发现扩展了对这类病原体遗传多样性的认知，其中B. elizabethae作为已知人类致病种，其新基因型的潜在毒力值得关注。

研究局限性在于样本量相对较小且未检测媒介生物（如跳蚤）的病原体携带状况。作者建议未来应开展跨物种传播动力学研究，并评估城市化梯度对病原体分布的影响。这项成果为西非城市人兽共患病风险预警提供了科学基线，尤其对马里这类缺乏病原体本底数据的国家具有特殊价值。